287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3277 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  78.78 
 
 		 243 aa  354  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  76.42 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  75.98 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  75.98 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  75.24 
 
 		 231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.98 
 
 		 193 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  69.89 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  65.82 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  69.43 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  58.01 
 
 		 191 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  55.74 
 
 		 282 aa  204  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.57 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.35 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.54 
 
 		 320 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  55.8 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.5 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  55.25 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  56.11 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.87 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.4 
 
 		 254 aa  184  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.98 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.68 
 
 		 196 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  52.08 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  52.75 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  43.81 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  49.26 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  52.11 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.45 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.91 
 
 		 224 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.11 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  50.57 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  51.18 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.78 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  43.01 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.33 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  43.27 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  45.06 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  39.67 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.02 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.14 
 
 		 189 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 181 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  34.78 
 
 		 183 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  41.36 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.24 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  36.57 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.4 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.38 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  38.61 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.63 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.97 
 
 		 387 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  37.97 
 
 		 372 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  36.05 
 
 		 193 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 		 171 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  36.08 
 
 		 171 aa  99.4  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 195 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.96 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  37.57 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.25 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.51 
 
 		 534 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  37.14 
 
 		 337 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.94 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.87 
 
 		 197 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  36.47 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  28.72 
 
 		 195 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  29.23 
 
 		 195 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  37.65 
 
 		 178 aa  95.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  37.87 
 
 		 198 aa  95.1  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  36.57 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 189 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  35.63 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 185 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  36.75 
 
 		 194 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  40 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  36.57 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  36.63 
 
 		 209 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  44.92 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  37.28 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  36.97 
 
 		 184 aa  92.4  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.28 
 
 		 206 aa  92.8  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  37.5 
 
 		 287 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  35.5 
 
 		 318 aa  92.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.52 
 
 		 176 aa  92  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.8 
 
 		 192 aa  91.7  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  32.16 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  41.77 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.48 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  34.86 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>