297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3424 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  49.1 
 
 
181 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  46.32 
 
 
195 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  43.78 
 
 
190 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.15 
 
 
187 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.4 
 
 
273 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  46.79 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  43.82 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  40.57 
 
 
282 aa  145  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  43.26 
 
 
190 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  43.82 
 
 
190 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  43.26 
 
 
190 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  43.26 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  43.26 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  43.26 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  43.26 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  43.26 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.7 
 
 
196 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  44.1 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  42.41 
 
 
189 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  44.38 
 
 
195 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.25 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  43.79 
 
 
195 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  43.82 
 
 
190 aa  134  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.28 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  44.94 
 
 
168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 
171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.76 
 
 
190 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  44.03 
 
 
192 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  42.14 
 
 
171 aa  131  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  38.69 
 
 
198 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  40.35 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.64 
 
 
222 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  47.83 
 
 
274 aa  128  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.96 
 
 
206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.65 
 
 
193 aa  128  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.16 
 
 
165 aa  128  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  42.05 
 
 
299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  43.12 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.1 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  43.03 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  44.3 
 
 
352 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  44.85 
 
 
387 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.12 
 
 
269 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  44.24 
 
 
372 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  41.86 
 
 
195 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  45.06 
 
 
201 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.24 
 
 
387 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  40.22 
 
 
274 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45 
 
 
189 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  41.1 
 
 
198 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  41.86 
 
 
198 aa  121  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  39.67 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  45.91 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  39.38 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  45.62 
 
 
200 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  43.12 
 
 
199 aa  119  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.67 
 
 
534 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.24 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 
245 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  39.15 
 
 
198 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  42.01 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  39.15 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.91 
 
 
209 aa  117  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.15 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  39.15 
 
 
198 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  42.01 
 
 
198 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  42.01 
 
 
198 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  42.01 
 
 
198 aa  117  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.67 
 
 
389 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  42.17 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  41.25 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  38.59 
 
 
280 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.12 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  37.91 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  41.42 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.4 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.96 
 
 
211 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  43.98 
 
 
219 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  39.05 
 
 
360 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  40.61 
 
 
242 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  35.79 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  43.11 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  41.72 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  39.05 
 
 
394 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  41.25 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 
214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  37.85 
 
 
340 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  40.62 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  40.25 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.95 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 
345 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  37.78 
 
 
345 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  37.85 
 
 
340 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 
345 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>