286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1318 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  42.46 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  43.33 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  42.17 
 
 		 237 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  41.21 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  41.44 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.78 
 
 		 192 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.08 
 
 		 195 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.66 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  42.53 
 
 		 236 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  41.75 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  39.89 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  40.48 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.15 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 		 447 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  40.11 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  40.11 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.41 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  43.71 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  39.2 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  40.41 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  39.89 
 
 		 299 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  41.28 
 
 		 372 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.68 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.28 
 
 		 387 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.96 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  41.12 
 
 		 263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  54.55 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40.7 
 
 		 387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  39.59 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  42.26 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.46 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  39.08 
 
 		 337 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 352 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  37.64 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 196 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  38.6 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  39.43 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.28 
 
 		 534 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.25 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  40.96 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.54 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.89 
 
 		 228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 332 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  38.2 
 
 		 287 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.64 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  37.36 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  37.06 
 
 		 352 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  39.44 
 
 		 264 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  36.87 
 
 		 257 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  37.36 
 
 		 255 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  40.59 
 
 		 330 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.04 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  37.93 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  37.93 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  37.93 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  37.93 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  39.41 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  38.98 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 186 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  40.94 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  40.94 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  38.41 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  38.86 
 
 		 256 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  38.69 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  36.31 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  41.42 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  41.42 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  35.56 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.57 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  41.42 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  41.42 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 		 190 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.46 
 
 		 193 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  39.41 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  40.8 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  36.76 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.29 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  37.79 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  39.2 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  37.97 
 
 		 247 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  40.94 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  38.58 
 
 		 353 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>