283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1490 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 337 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  84.23 
 
 		 257 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  83.4 
 
 		 255 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  83.68 
 
 		 259 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  81.93 
 
 		 277 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  80.91 
 
 		 255 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  80.17 
 
 		 256 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  77.92 
 
 		 264 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  66.79 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  66.67 
 
 		 332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  68.77 
 
 		 263 aa  338  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  71.7 
 
 		 221 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  65 
 
 		 236 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  57.95 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  60 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  57.78 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  58.56 
 
 		 291 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  53.41 
 
 		 222 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  58.33 
 
 		 201 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  57.65 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  57.65 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  54.82 
 
 		 194 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  53.85 
 
 		 193 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  59.48 
 
 		 210 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  56.55 
 
 		 209 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  53.25 
 
 		 193 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  56.55 
 
 		 209 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  50.92 
 
 		 250 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  52.33 
 
 		 184 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  48.82 
 
 		 197 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  48.08 
 
 		 221 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.75 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  49.13 
 
 		 178 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 245 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  46.55 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  46.51 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.89 
 
 		 198 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  44.89 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  45.98 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  39.71 
 
 		 345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  44.89 
 
 		 198 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  44.89 
 
 		 198 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  47.13 
 
 		 456 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  47.13 
 
 		 456 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  37.55 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  47.13 
 
 		 455 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  37.55 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  44.32 
 
 		 198 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  47.13 
 
 		 458 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  47.13 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.59 
 
 		 228 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  42.79 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  44.32 
 
 		 210 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  48.47 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  48.47 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  48.47 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  44.89 
 
 		 198 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  44.89 
 
 		 198 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  48.47 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  45.88 
 
 		 226 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  44.89 
 
 		 198 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  46.41 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  43.35 
 
 		 206 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  45.09 
 
 		 198 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  46.06 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  44.32 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.89 
 
 		 200 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.32 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  44.63 
 
 		 198 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  44.77 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  45.96 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  45.34 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  45.34 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  44.72 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.72 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  42.24 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.7 
 
 		 194 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  46.54 
 
 		 230 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  45.34 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  37.07 
 
 		 246 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  40.7 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  44.72 
 
 		 206 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 211 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.29 
 
 		 534 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  38.35 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 221 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  43.02 
 
 		 195 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 186 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  44.97 
 
 		 177 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  44.97 
 
 		 177 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  37.14 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 219 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  36.16 
 
 		 183 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  42.07 
 
 		 183 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.36 
 
 		 192 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.89 
 
 		 192 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>