278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1721 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 352 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  58.77 
 
 		 236 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  61.99 
 
 		 259 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  62.57 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  61.62 
 
 		 221 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  53.33 
 
 		 255 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  53.43 
 
 		 337 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  62.57 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  60.23 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  52.86 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  55.81 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  61.4 
 
 		 255 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  60.36 
 
 		 332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  60.82 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  50.46 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  58.33 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  51.43 
 
 		 291 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  53.05 
 
 		 222 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  56.9 
 
 		 194 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  55.93 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  59.28 
 
 		 201 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  55.93 
 
 		 247 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  55.56 
 
 		 209 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  55.56 
 
 		 209 aa  209  8e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  56.22 
 
 		 210 aa  209  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  54.22 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  49.43 
 
 		 193 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  48.08 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.88 
 
 		 200 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  50.28 
 
 		 408 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  52.63 
 
 		 198 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  52.63 
 
 		 198 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  52.63 
 
 		 198 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  52.63 
 
 		 198 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  48.88 
 
 		 214 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  50.29 
 
 		 245 aa  189  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  50.57 
 
 		 226 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  53.66 
 
 		 197 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  51.55 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  48.91 
 
 		 198 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  51.55 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  51.55 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.05 
 
 		 198 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  52.05 
 
 		 198 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  52.05 
 
 		 198 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  47.94 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  51.55 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  52.17 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  51.46 
 
 		 198 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  51.53 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  50.93 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  48.65 
 
 		 198 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  45.5 
 
 		 206 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  50.92 
 
 		 345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  50.92 
 
 		 345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  50.92 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.17 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  50.93 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  47.7 
 
 		 210 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  47.71 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.04 
 
 		 234 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  48.04 
 
 		 234 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  52.8 
 
 		 304 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  50.93 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  50.93 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  50.93 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  50.93 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  50.93 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  50.59 
 
 		 221 aa  179  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  52.17 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  50 
 
 		 184 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.76 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  51.55 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  51.53 
 
 		 274 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 198 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  50.61 
 
 		 178 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  50.92 
 
 		 254 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  50.31 
 
 		 244 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.57 
 
 		 228 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  53.37 
 
 		 216 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  47.85 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  50.31 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  49.08 
 
 		 246 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  44.9 
 
 		 206 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  50.31 
 
 		 221 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  47.47 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  35.6 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.52 
 
 		 534 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  40.46 
 
 		 206 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.05 
 
 		 195 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  43.6 
 
 		 195 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.13 
 
 		 195 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.97 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  46.97 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  47.24 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.56 
 
 		 194 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  47.1 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  38.95 
 
 		 192 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>