293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2232 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
196 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  77.78 
 
 
273 aa  295  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  61.58 
 
 
190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  61.05 
 
 
190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  60.53 
 
 
190 aa  232  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  61.05 
 
 
190 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  61.05 
 
 
190 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  61.05 
 
 
190 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  61.05 
 
 
190 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  61.05 
 
 
190 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  61.05 
 
 
190 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  60.53 
 
 
190 aa  228  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  61.58 
 
 
190 aa  221  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.78 
 
 
187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  50 
 
 
183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  50 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  47.75 
 
 
195 aa  160  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  43.43 
 
 
199 aa  158  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  47.43 
 
 
195 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  46.86 
 
 
195 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.31 
 
 
196 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  42.37 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  45.51 
 
 
195 aa  148  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  41.99 
 
 
189 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.83 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.24 
 
 
192 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  47.8 
 
 
168 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  43.11 
 
 
198 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  42.78 
 
 
201 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  42.62 
 
 
282 aa  142  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  41.45 
 
 
188 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  45.66 
 
 
192 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  48.45 
 
 
179 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf011  segregation and condensation protein B  41.99 
 
 
206 aa  141  6e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.11 
 
 
269 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  44.12 
 
 
284 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.21 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  39.38 
 
 
193 aa  136  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  46.47 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  42.37 
 
 
243 aa  134  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  42.22 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.34 
 
 
534 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.12 
 
 
225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  40.57 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  44.25 
 
 
193 aa  130  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  44.25 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  46.71 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.08 
 
 
387 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  44.62 
 
 
236 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  42.08 
 
 
372 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  46.15 
 
 
274 aa  128  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  42.69 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  44.44 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.55 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40.83 
 
 
387 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  39.81 
 
 
299 aa  124  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.97 
 
 
211 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.82 
 
 
193 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  41.82 
 
 
201 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
388 aa  124  1e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  41.33 
 
 
200 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  39.41 
 
 
205 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  43.11 
 
 
197 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.31 
 
 
165 aa  122  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.8 
 
 
222 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.11 
 
 
197 aa  121  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.57 
 
 
179 aa  121  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  40.7 
 
 
226 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  40.98 
 
 
352 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  41.28 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.11 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  41.44 
 
 
254 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 
180 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  41.44 
 
 
247 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.43 
 
 
252 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 
243 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  41.57 
 
 
352 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  37.91 
 
 
282 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  41.36 
 
 
221 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  41.32 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  40.11 
 
 
198 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  36.69 
 
 
237 aa  117  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.22 
 
 
206 aa  117  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.22 
 
 
447 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  39.49 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  40.11 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.64 
 
 
254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  40.11 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  40.11 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  40.72 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  40.11 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>