290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0308 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  100 
 
 
193 aa  388  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  63.73 
 
 
194 aa  249  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  49.72 
 
 
188 aa  189  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  44.81 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  44.15 
 
 
196 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  46.3 
 
 
199 aa  156  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  43.33 
 
 
201 aa  151  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.32 
 
 
187 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.32 
 
 
273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.25 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  38.98 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 
190 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 
190 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 
190 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.25 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  39.18 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.21 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  37.14 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  38.29 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 
318 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.14 
 
 
284 aa  114  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 
168 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  37.93 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  40.12 
 
 
195 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 
171 aa  108  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  34.21 
 
 
198 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  36.88 
 
 
205 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 
181 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  39.63 
 
 
274 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.24 
 
 
179 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0601  chromosomal segregation and condensation protein B  38.18 
 
 
209 aa  105  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  34.57 
 
 
282 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  37.5 
 
 
224 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36 
 
 
269 aa  105  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.66 
 
 
190 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  36.59 
 
 
237 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  35.2 
 
 
372 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  34.39 
 
 
183 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.2 
 
 
387 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.94 
 
 
193 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.7 
 
 
196 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  35.85 
 
 
189 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.14 
 
 
197 aa  100  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.36 
 
 
252 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.41 
 
 
211 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.1 
 
 
173 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  34.08 
 
 
387 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  37.74 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 
228 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.71 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  36.42 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  36.94 
 
 
241 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  33.87 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 
224 aa  95.9  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  36.59 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  36.31 
 
 
287 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.76 
 
 
254 aa  95.5  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.83 
 
 
176 aa  95.9  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  39.33 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  35.12 
 
 
388 aa  95.5  4e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  33.89 
 
 
352 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.69 
 
 
194 aa  95.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  39.38 
 
 
194 aa  94.4  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 
221 aa  93.6  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  38.73 
 
 
195 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  34.95 
 
 
259 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  36.36 
 
 
257 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 
238 aa  93.2  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.58 
 
 
261 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  37.58 
 
 
385 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  40 
 
 
353 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.36 
 
 
534 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  34.32 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.15 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  36.96 
 
 
256 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  35.15 
 
 
206 aa  92  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  34.92 
 
 
244 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.59 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.97 
 
 
224 aa  91.3  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  33.52 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  35.83 
 
 
255 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.44 
 
 
165 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  39.37 
 
 
278 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  36.09 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  38.66 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  36.9 
 
 
264 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.58 
 
 
220 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  34.64 
 
 
209 aa  89  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>