288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1397 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  49.72 
 
 
193 aa  189  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  46.91 
 
 
194 aa  185  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  43.37 
 
 
196 aa  155  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  44.05 
 
 
201 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  44.58 
 
 
199 aa  150  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  39.89 
 
 
199 aa  141  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.46 
 
 
273 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.5 
 
 
196 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  36.11 
 
 
190 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.31 
 
 
187 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
195 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
195 aa  121  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 
168 aa  117  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.17 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  36.41 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.3 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  36.41 
 
 
190 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  36.41 
 
 
190 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  36.41 
 
 
190 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  36.41 
 
 
190 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  36.41 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  34.86 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  35.87 
 
 
190 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.76 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  37.29 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 
284 aa  111  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  35.98 
 
 
243 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 
171 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
189 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.88 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  34.59 
 
 
179 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 
184 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  34.39 
 
 
198 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.58 
 
 
197 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  34.59 
 
 
387 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  34.05 
 
 
372 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.05 
 
 
387 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  33.74 
 
 
171 aa  101  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 
211 aa  101  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  34.16 
 
 
282 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  36.04 
 
 
353 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 
221 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 
181 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  39.33 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  34.83 
 
 
274 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.29 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.84 
 
 
222 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 
352 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.94 
 
 
534 aa  97.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  40.48 
 
 
237 aa  97.8  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  36.36 
 
 
287 aa  97.8  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  31.74 
 
 
238 aa  97.1  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.71 
 
 
269 aa  97.1  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  30.86 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 
254 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.52 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  33.74 
 
 
224 aa  95.9  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  34.16 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
225 aa  95.5  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  36.31 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 
197 aa  95.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 
221 aa  94.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 
250 aa  94.4  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  34.36 
 
 
299 aa  94.4  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  35.06 
 
 
209 aa  94.4  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
192 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 
198 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 
198 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.93 
 
 
198 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 
198 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  34.93 
 
 
311 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  35.67 
 
 
245 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  36.55 
 
 
198 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  36 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  35.76 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  38.26 
 
 
318 aa  92  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  37.6 
 
 
399 aa  92  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.42 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  36.55 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  36.55 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  36.55 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  91.7  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 
212 aa  92  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  34.48 
 
 
209 aa  91.7  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  33.13 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.88 
 
 
174 aa  91.7  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 
388 aa  91.7  6e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  33.54 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  35.52 
 
 
226 aa  90.9  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>