271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1269 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
208 aa  416  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.32 
 
 
224 aa  192  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  53.03 
 
 
224 aa  185  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.33 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.84 
 
 
254 aa  178  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  52.31 
 
 
253 aa  175  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  48.19 
 
 
229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.28 
 
 
252 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
251 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  50 
 
 
238 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.87 
 
 
221 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.14 
 
 
279 aa  165  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.29 
 
 
205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  51.4 
 
 
241 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  51.46 
 
 
205 aa  164  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  52.41 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  48.89 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  47.57 
 
 
191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50 
 
 
261 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.66 
 
 
196 aa  160  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  49.15 
 
 
252 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.2 
 
 
224 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  46.74 
 
 
282 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  55.13 
 
 
191 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.26 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  46.93 
 
 
231 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  42.25 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  42.25 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  42.25 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  49.69 
 
 
238 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  43.89 
 
 
243 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.63 
 
 
193 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  49.11 
 
 
229 aa  141  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.65 
 
 
320 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  41.08 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  42.31 
 
 
243 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.91 
 
 
269 aa  133  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.79 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.85 
 
 
193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  43.48 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  41.34 
 
 
274 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  40.37 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.86 
 
 
189 aa  111  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  42.33 
 
 
387 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  41.72 
 
 
372 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.72 
 
 
387 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 
352 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  37.36 
 
 
171 aa  105  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.94 
 
 
196 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  38.92 
 
 
171 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 
168 aa  101  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 
209 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.5 
 
 
209 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.68 
 
 
273 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  34.68 
 
 
212 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  39.75 
 
 
181 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  36.59 
 
 
190 aa  99  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.69 
 
 
187 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  32.72 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  41.36 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
282 aa  99  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  37.77 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  36.59 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  36.59 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.97 
 
 
222 aa  97.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  36.59 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  36.59 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  36.59 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  35.37 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  35.98 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.18 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.43 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  35.11 
 
 
299 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  32.52 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.62 
 
 
174 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.63 
 
 
534 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 
195 aa  95.5  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  39.69 
 
 
343 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
349 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  34.97 
 
 
190 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  40 
 
 
340 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 
179 aa  94.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  39.49 
 
 
340 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  37.71 
 
 
178 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  40 
 
 
345 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  40 
 
 
345 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  35.37 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  40 
 
 
345 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 
311 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  38.32 
 
 
302 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.81 
 
 
192 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  43.97 
 
 
353 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>