281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 252 aa  487  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  73.33 
 
 		 193 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  68.21 
 
 		 231 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  68.13 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  68.75 
 
 		 231 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  68.75 
 
 		 231 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  58.45 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  69.89 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  66.09 
 
 		 279 aa  228  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  61.93 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  72.83 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  68.48 
 
 		 229 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  61.18 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.38 
 
 		 196 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.52 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.65 
 
 		 205 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  56.65 
 
 		 241 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.79 
 
 		 320 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.82 
 
 		 220 aa  198  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  56.5 
 
 		 193 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.69 
 
 		 261 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  52.75 
 
 		 185 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  55.81 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  53.76 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.29 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.43 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.3 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  52.91 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  45.13 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  54.17 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  56.07 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  42.06 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  54.8 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.15 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.71 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.02 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  43.83 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  44.12 
 
 		 195 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.44 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.26 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.94 
 
 		 193 aa  111  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.14 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  42.35 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  35.62 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  36.75 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.43 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  36.75 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  35.58 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  36.14 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  36.14 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  36.14 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  36.14 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 		 180 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  37.87 
 
 		 186 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 		 180 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  36.14 
 
 		 190 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  41.23 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  38.76 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  37.11 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.52 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  38.76 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  38.64 
 
 		 337 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.33 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.89 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 		 171 aa  99  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.61 
 
 		 196 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.75 
 
 		 387 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  38.75 
 
 		 372 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  35.58 
 
 		 299 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  37.43 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  36.57 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  44.27 
 
 		 394 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  38.12 
 
 		 387 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  31.87 
 
 		 195 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.55 
 
 		 178 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.96 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  35.5 
 
 		 194 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  39.23 
 
 		 196 aa  95.9  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  34.16 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  37.58 
 
 		 212 aa  95.9  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.39 
 
 		 201 aa  95.5  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.48 
 
 		 196 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  44.62 
 
 		 360 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30.77 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.91 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  35.58 
 
 		 190 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  37.71 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  40.17 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  43.85 
 
 		 442 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  43.51 
 
 		 408 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  43.85 
 
 		 456 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>