284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3121 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  57.66 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.57 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  64.74 
 
 		 185 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  63.31 
 
 		 193 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  58.62 
 
 		 191 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  58.62 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.91 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.33 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.36 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.28 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  58.29 
 
 		 205 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.23 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.54 
 
 		 196 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  54.03 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.49 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  52.02 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.23 
 
 		 193 aa  188  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  60.95 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  53.76 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  55.8 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  48.65 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  48.65 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.29 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  52.13 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  56.11 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.25 
 
 		 279 aa  181  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.96 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  52.97 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  60.65 
 
 		 191 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.02 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  59.35 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.05 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  52.35 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.7 
 
 		 225 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  54.32 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.66 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  49.69 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  43.65 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  38.19 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.3 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.18 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  43.71 
 
 		 181 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.51 
 
 		 192 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.76 
 
 		 387 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  44.7 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  42.51 
 
 		 192 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  39.76 
 
 		 372 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  39.76 
 
 		 387 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  32.52 
 
 		 198 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  43.87 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.55 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 171 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.48 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  44.08 
 
 		 184 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.36 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 		 184 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 179 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  36.87 
 
 		 193 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  31.33 
 
 		 195 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 190 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30.72 
 
 		 195 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  34.18 
 
 		 171 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.9 
 
 		 534 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  37.42 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.25 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.08 
 
 		 197 aa  99.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 		 179 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 201 aa  99.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  31.9 
 
 		 183 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  38.55 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  30.12 
 
 		 189 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  42.57 
 
 		 187 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.02 
 
 		 187 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  35.8 
 
 		 190 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.59 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.8 
 
 		 211 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  38.69 
 
 		 195 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.75 
 
 		 196 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.63 
 
 		 174 aa  96.3  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.12 
 
 		 222 aa  95.9  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  35.15 
 
 		 199 aa  95.5  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  33.54 
 
 		 202 aa  95.5  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  35.22 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  38.32 
 
 		 360 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.98 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  37.2 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>