292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2135 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 174 aa  330  8e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  68.35 
 
 		 173 aa  210  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  46.01 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  45.51 
 
 		 372 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  43.98 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.51 
 
 		 387 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  44.87 
 
 		 387 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.75 
 
 		 534 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 352 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  39.38 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  44.91 
 
 		 201 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  42.26 
 
 		 206 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.01 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  39.35 
 
 		 282 aa  116  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.32 
 
 		 225 aa  114  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.2 
 
 		 228 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.05 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.31 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.32 
 
 		 269 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 221 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.64 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  35.54 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.23 
 
 		 222 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  40.51 
 
 		 205 aa  110  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  37.28 
 
 		 299 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  38.55 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  47.71 
 
 		 274 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.41 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.15 
 
 		 198 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  36.75 
 
 		 195 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  39.77 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  36.14 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  37.65 
 
 		 304 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  39.05 
 
 		 360 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  30.72 
 
 		 237 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  37.87 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.72 
 
 		 389 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.59 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  42.94 
 
 		 263 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 349 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.68 
 
 		 206 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  37.71 
 
 		 274 aa  104  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  37.43 
 
 		 214 aa  104  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  37.06 
 
 		 280 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  40.83 
 
 		 277 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  39.41 
 
 		 255 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.34 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  44.05 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 340 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 254 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.28 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  38.24 
 
 		 352 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  37.28 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  33.92 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  39.52 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 245 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 340 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 345 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  39.63 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  33.53 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  37.13 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 		 343 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  48.11 
 
 		 318 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 458 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.58 
 
 		 281 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  36.53 
 
 		 302 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  42.5 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 330 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  42.5 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 442 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  37.65 
 
 		 337 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 442 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 332 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 442 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 442 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>