286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2125 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  73.44 
 
 		 198 aa  288  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  73.44 
 
 		 198 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  73.44 
 
 		 198 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  73.44 
 
 		 198 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  76.37 
 
 		 206 aa  287  6e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  70.2 
 
 		 198 aa  287  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  71.35 
 
 		 198 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  71.35 
 
 		 198 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  71.35 
 
 		 198 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  71.35 
 
 		 198 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  70.83 
 
 		 198 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  70.1 
 
 		 226 aa  271  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  70.65 
 
 		 245 aa  271  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  67.86 
 
 		 214 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  58.43 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  59.06 
 
 		 250 aa  222  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  51.18 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  49.47 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  48.94 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  47.98 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  47.22 
 
 		 352 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  50.9 
 
 		 408 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  50.9 
 
 		 394 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  46.35 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  48.26 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 360 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  52.05 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  50.91 
 
 		 343 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 349 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  50.91 
 
 		 340 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  50.91 
 
 		 345 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  50.91 
 
 		 345 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  50.91 
 
 		 345 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  50.91 
 
 		 340 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 456 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  50.31 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 456 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 458 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  50.92 
 
 		 261 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 455 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  46.24 
 
 		 254 aa  167  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  46.24 
 
 		 247 aa  167  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  48.82 
 
 		 311 aa  167  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  49.7 
 
 		 302 aa  167  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  48.5 
 
 		 304 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  48.54 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  48.48 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  49.7 
 
 		 442 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  49.7 
 
 		 442 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  49.7 
 
 		 442 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  49.7 
 
 		 442 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  49.43 
 
 		 399 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  49.08 
 
 		 244 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  49.1 
 
 		 280 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.37 
 
 		 234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  45.99 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  47.37 
 
 		 234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.1 
 
 		 389 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  47.56 
 
 		 178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  48.48 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  48.48 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  45.56 
 
 		 291 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.92 
 
 		 281 aa  161  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  44.83 
 
 		 193 aa  160  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  45.24 
 
 		 193 aa  160  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  47.34 
 
 		 274 aa  160  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  46.99 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  47.46 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  50.31 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  46.59 
 
 		 257 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  46.59 
 
 		 255 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  48.3 
 
 		 263 aa  157  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  47.46 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  47.09 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  46.63 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  45.26 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  47.09 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  44.63 
 
 		 337 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  47.37 
 
 		 264 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  46.11 
 
 		 184 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.68 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  43.68 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 330 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.39 
 
 		 228 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  45.24 
 
 		 332 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  44.21 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  41.4 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.67 
 
 		 534 aa  137  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.42 
 
 		 192 aa  130  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.36 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  37.37 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  39.31 
 
 		 372 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  39.89 
 
 		 352 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.31 
 
 		 387 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 		 299 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.04 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  42.35 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>