289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_15670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  100 
 
 
263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  68.77 
 
 
337 aa  338  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  72.38 
 
 
259 aa  337  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  74.19 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  71.97 
 
 
277 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  69.05 
 
 
255 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  70.83 
 
 
257 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  69.02 
 
 
256 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  63.32 
 
 
330 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  63.57 
 
 
332 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  71.85 
 
 
255 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  69.14 
 
 
236 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  70.95 
 
 
221 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  62.21 
 
 
352 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  63.79 
 
 
287 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  59.66 
 
 
222 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  67.27 
 
 
201 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  59.2 
 
 
399 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  61.68 
 
 
291 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  55.15 
 
 
209 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  55.15 
 
 
209 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  59.88 
 
 
194 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  64.05 
 
 
210 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  57.06 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  57.06 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  47.54 
 
 
193 aa  188  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  50.91 
 
 
193 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  51.83 
 
 
250 aa  185  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  52.94 
 
 
197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  58.43 
 
 
184 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  53.59 
 
 
221 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  47.43 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.49 
 
 
228 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 
198 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.6 
 
 
198 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  48.6 
 
 
198 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  50 
 
 
408 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  48.6 
 
 
198 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  48.04 
 
 
198 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  48.85 
 
 
214 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  47.83 
 
 
198 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  47.83 
 
 
198 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  47.83 
 
 
198 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  49.4 
 
 
394 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  47.28 
 
 
198 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  47.7 
 
 
210 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  49.09 
 
 
360 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  51.19 
 
 
178 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  46.03 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  44.69 
 
 
198 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  44.69 
 
 
206 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 
455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  47.88 
 
 
349 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 
442 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 
442 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 
442 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 
442 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  47.27 
 
 
343 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  47.88 
 
 
458 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  47.27 
 
 
340 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  49.09 
 
 
302 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 
345 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 
345 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  47.27 
 
 
345 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 
340 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  49.09 
 
 
311 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  47.88 
 
 
280 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.51 
 
 
389 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  47.27 
 
 
304 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  48.3 
 
 
198 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  48.26 
 
 
261 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  48.47 
 
 
206 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  46.77 
 
 
274 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  47.2 
 
 
254 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.7 
 
 
200 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  46.58 
 
 
246 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  43.16 
 
 
244 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  47.88 
 
 
234 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.88 
 
 
234 aa  148  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  48.5 
 
 
211 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  48.47 
 
 
230 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  47.88 
 
 
216 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 
221 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  44.56 
 
 
278 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.48 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.17 
 
 
281 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
219 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.95 
 
 
534 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  38.14 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.18 
 
 
195 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
186 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  46.67 
 
 
177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  46.67 
 
 
177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  41.25 
 
 
183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  41.27 
 
 
195 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  42.07 
 
 
183 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.08 
 
 
192 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.66 
 
 
192 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>