283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1839 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 264 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  82.5 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  78.16 
 
 		 255 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  79.67 
 
 		 277 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  79.58 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  78.33 
 
 		 337 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  78.88 
 
 		 256 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  79.27 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  70.23 
 
 		 330 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  74.6 
 
 		 263 aa  345  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  70.83 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  75.32 
 
 		 221 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  65.22 
 
 		 236 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  62.57 
 
 		 352 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  61.75 
 
 		 291 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  58.92 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  59.54 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  54.64 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  54.64 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  55.43 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  60.45 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  56.5 
 
 		 194 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  54.82 
 
 		 193 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  54.22 
 
 		 193 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  61.54 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  60.87 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  60.87 
 
 		 209 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  53.99 
 
 		 250 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  57.23 
 
 		 184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  49.16 
 
 		 197 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  51.85 
 
 		 221 aa  175  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  49.7 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  44.55 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  48.52 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  49.13 
 
 		 198 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.13 
 
 		 198 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  49.13 
 
 		 198 aa  168  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  49.13 
 
 		 198 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  48.55 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  51.19 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  50.62 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  49.71 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  49.71 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  49.71 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  49.13 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  45.51 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  43.98 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  49.38 
 
 		 394 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  48.19 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.98 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  41.05 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  48.26 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  48.81 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.26 
 
 		 389 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  45.79 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  45.79 
 
 		 340 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  48.19 
 
 		 456 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  48.19 
 
 		 456 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.02 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  48.19 
 
 		 455 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  49.07 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  49.07 
 
 		 458 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  48.45 
 
 		 345 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  48.45 
 
 		 345 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  48.45 
 
 		 345 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  48.19 
 
 		 442 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  48.19 
 
 		 442 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  48.19 
 
 		 442 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  48.19 
 
 		 442 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  54.2 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  46.99 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  41.86 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  48.26 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.09 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  49.38 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  47.09 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  39.18 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  47.09 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.79 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  42.29 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  45.4 
 
 		 206 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  41.71 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  44.83 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 211 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  44.19 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.1 
 
 		 194 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  47.88 
 
 		 177 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  47.88 
 
 		 177 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.19 
 
 		 534 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  46.56 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  48.46 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  38.97 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  44.7 
 
 		 183 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  36.57 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  43.29 
 
 		 183 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  43.6 
 
 		 195 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.77 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.2 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>