284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5640 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
534 aa  1007    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  54.37 
 
 
352 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  54.9 
 
 
372 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.9 
 
 
387 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  56.98 
 
 
387 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  49.4 
 
 
299 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  53.76 
 
 
195 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  51.19 
 
 
195 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  51.48 
 
 
192 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.07 
 
 
192 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 
206 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  52.38 
 
 
189 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  50 
 
 
195 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  41.36 
 
 
282 aa  153  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  51.74 
 
 
200 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  47.98 
 
 
222 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  41.52 
 
 
352 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 
250 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  47.14 
 
 
353 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  46.47 
 
 
330 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  47.56 
 
 
332 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 
221 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  47.16 
 
 
195 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  47.27 
 
 
226 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 
210 aa  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  47.09 
 
 
236 aa  140  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 
214 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  45.96 
 
 
209 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  45.35 
 
 
256 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  45.93 
 
 
259 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  47.88 
 
 
198 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  47.88 
 
 
198 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  45.35 
 
 
255 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.88 
 
 
198 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  48.19 
 
 
198 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  44.85 
 
 
198 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  44 
 
 
195 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  48.19 
 
 
198 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  48.19 
 
 
198 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  48.19 
 
 
198 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  42.01 
 
 
399 aa  136  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  47.88 
 
 
198 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  47.88 
 
 
198 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  43.43 
 
 
195 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 
198 aa  136  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  38.62 
 
 
277 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  44.31 
 
 
201 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  45.34 
 
 
209 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  47.56 
 
 
263 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.52 
 
 
231 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  52.71 
 
 
210 aa  134  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  46.91 
 
 
385 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  44.19 
 
 
255 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  43.2 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  42.29 
 
 
337 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  44.51 
 
 
197 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
442 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  44.19 
 
 
257 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
442 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
455 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
442 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
442 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  46.06 
 
 
206 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  44.71 
 
 
264 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
245 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.86 
 
 
193 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
458 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  40.48 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  43.75 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  43.75 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  51.94 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 
360 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  40.48 
 
 
193 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  44.71 
 
 
221 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.16 
 
 
343 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  43.48 
 
 
183 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  43.6 
 
 
311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  44.94 
 
 
432 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  43.83 
 
 
349 aa  126  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  43.83 
 
 
345 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  43.83 
 
 
340 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  46.2 
 
 
358 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  44.65 
 
 
302 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.75 
 
 
273 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  43.83 
 
 
345 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  36.89 
 
 
261 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  43.83 
 
 
345 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 
179 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 
242 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 
201 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  43.83 
 
 
340 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  43.4 
 
 
215 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.45 
 
 
196 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  42.68 
 
 
184 aa  124  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  44.17 
 
 
181 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  46.2 
 
 
389 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45 
 
 
228 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  39.36 
 
 
287 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>