294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1135 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  52.81 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.1 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.39 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  47.19 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  46.63 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  47.31 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  154  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.68 
 
 		 196 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  47.62 
 
 		 190 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.26 
 
 		 273 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  43.6 
 
 		 282 aa  148  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  45.24 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  46.2 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  43.98 
 
 		 387 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  48.21 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.63 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  43.37 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  42.5 
 
 		 198 aa  140  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 		 387 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 		 372 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.2 
 
 		 269 aa  138  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  45.4 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  45.2 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.54 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  46.34 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.33 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  42.6 
 
 		 352 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.76 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  45.56 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.76 
 
 		 284 aa  134  7.000000000000001e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.34 
 
 		 225 aa  133  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 243 aa  132  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  39.2 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  43.56 
 
 		 299 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  44.24 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.79 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.59 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  41.42 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  41.38 
 
 		 304 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.42 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.95 
 
 		 222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  41.42 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.83 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.56 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  41.42 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  41.42 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  41.32 
 
 		 209 aa  127  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  41.76 
 
 		 226 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  42.44 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  41.24 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  41.38 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.62 
 
 		 389 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  41.14 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  41.82 
 
 		 193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  45.18 
 
 		 302 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  41.32 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  40.83 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  43.1 
 
 		 311 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.42 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  43.5 
 
 		 201 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  40.11 
 
 		 198 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  40.83 
 
 		 198 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  40.83 
 
 		 198 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  40.83 
 
 		 198 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.05 
 
 		 254 aa  124  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  40.49 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  42.44 
 
 		 254 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.03 
 
 		 252 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 251 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  42.22 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.25 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  35.85 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  44.79 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 214 aa  121  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  42.07 
 
 		 261 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 245 aa  121  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  41.46 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.34 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  34.68 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  42.07 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  41.38 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.37 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  43.03 
 
 		 408 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  41.07 
 
 		 206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  42.33 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.66 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  46.75 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 243 aa  117  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.65 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>