292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2759 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  52.41 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.4 
 
 		 534 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50 
 
 		 192 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  48.85 
 
 		 192 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  49.71 
 
 		 195 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  50.3 
 
 		 195 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  50.26 
 
 		 189 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  45.81 
 
 		 352 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  53.85 
 
 		 195 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  41.47 
 
 		 387 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.47 
 
 		 387 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  41.47 
 
 		 372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  48.63 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.29 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  47.06 
 
 		 201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  40.74 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  35.25 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  34.39 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  41.98 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 250 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  50 
 
 		 194 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  36.45 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  36.45 
 
 		 209 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.33 
 
 		 197 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  39.43 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  39.36 
 
 		 221 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  39.2 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  47.45 
 
 		 210 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 221 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  40.34 
 
 		 193 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  39.66 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  40.34 
 
 		 193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  37.82 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  42.69 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.69 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  42.69 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  38.14 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  42.69 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  42.11 
 
 		 198 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  42.11 
 
 		 198 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  42.69 
 
 		 198 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  42.11 
 
 		 198 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  38.86 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.46 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  41.52 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.55 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.65 
 
 		 198 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 442 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 456 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 442 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  36.98 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.69 
 
 		 228 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 442 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 442 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 456 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 455 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  35.84 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  37.14 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 458 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  33.05 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 213 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  40 
 
 		 195 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  36.84 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  38.42 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.38 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  36.84 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  38.55 
 
 		 183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  35.89 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  35.4 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  36.84 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  36.16 
 
 		 226 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  32.73 
 
 		 360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 		 210 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 		 190 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  43.56 
 
 		 181 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 		 190 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  35.86 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  38.6 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.33 
 
 		 197 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  36.72 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  39.18 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  35.33 
 
 		 237 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  33.86 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.29 
 
 		 225 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  36.17 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 190 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.95 
 
 		 178 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  35.5 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  40.72 
 
 		 171 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  34.39 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>