293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1683 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  100 
 
 
387 aa  739    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  90.03 
 
 
372 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  90.61 
 
 
387 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  75.92 
 
 
352 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.5 
 
 
534 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  56.14 
 
 
195 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.72 
 
 
192 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  50.57 
 
 
192 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  54.76 
 
 
195 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  53.23 
 
 
195 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40.09 
 
 
299 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  50.29 
 
 
206 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  50.59 
 
 
189 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  49.45 
 
 
200 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  46.41 
 
 
195 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  42.69 
 
 
282 aa  142  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  43.79 
 
 
181 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  39.5 
 
 
243 aa  138  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.39 
 
 
222 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  47.24 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  40.56 
 
 
195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  37.31 
 
 
195 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  35.1 
 
 
237 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 
198 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  44.12 
 
 
221 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  40.83 
 
 
408 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 
349 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.21 
 
 
165 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  42.51 
 
 
205 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 
197 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  43.48 
 
 
171 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  41.99 
 
 
236 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  38.6 
 
 
209 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
455 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.85 
 
 
196 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 
343 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  37.56 
 
 
284 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 
250 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 
394 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 
209 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 
345 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 
345 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  41.42 
 
 
201 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.79 
 
 
189 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.87 
 
 
174 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  37.58 
 
 
183 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
345 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 
360 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 
340 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.18 
 
 
225 aa  123  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  40.12 
 
 
198 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 
340 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 
198 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  35.91 
 
 
197 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.54 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.11 
 
 
269 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.53 
 
 
198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  40.83 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  38.82 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 
198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 
198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 
198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  37.64 
 
 
210 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  41.32 
 
 
198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  41.32 
 
 
198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  41.32 
 
 
198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  42.42 
 
 
274 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  35.88 
 
 
213 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  39.05 
 
 
302 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  42.69 
 
 
194 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  44.17 
 
 
206 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  37.79 
 
 
198 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  34.64 
 
 
198 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 
280 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.71 
 
 
206 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  39.05 
 
 
304 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.21 
 
 
193 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.42 
 
 
234 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 
245 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.11 
 
 
200 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  42.53 
 
 
221 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
196 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  42.42 
 
 
234 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 
214 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  47.01 
 
 
255 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  38.86 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  46.67 
 
 
256 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  47.01 
 
 
277 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 
221 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  38.29 
 
 
291 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  42.04 
 
 
253 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  35.15 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>