280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3862 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  100 
 
 
353 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.14 
 
 
534 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  43.54 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  43.54 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.54 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.26 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  43.97 
 
 
192 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 
352 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.62 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  45.59 
 
 
171 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  51.16 
 
 
195 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  43.75 
 
 
200 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  41.26 
 
 
195 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  43.24 
 
 
183 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 
299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  45.26 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  46.61 
 
 
243 aa  119  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.85 
 
 
252 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.55 
 
 
195 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
206 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  34.12 
 
 
318 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  41.09 
 
 
237 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  39.57 
 
 
198 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  44.85 
 
 
195 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.04 
 
 
222 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  44.12 
 
 
195 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  44.52 
 
 
199 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  43.97 
 
 
190 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  44.7 
 
 
251 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  44.53 
 
 
205 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  46.4 
 
 
181 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.46 
 
 
269 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  45.07 
 
 
190 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  41.91 
 
 
210 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  45.39 
 
 
190 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  45.39 
 
 
190 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  45.39 
 
 
190 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  45.07 
 
 
190 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  45.39 
 
 
190 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.21 
 
 
273 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.36 
 
 
197 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  45.39 
 
 
190 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  43.45 
 
 
193 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  41.91 
 
 
302 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  45.07 
 
 
190 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.55 
 
 
200 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  45.39 
 
 
190 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 
349 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  44.06 
 
 
194 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  45 
 
 
190 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 
198 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.57 
 
 
196 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  44.53 
 
 
241 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 
189 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  41.48 
 
 
193 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  35.32 
 
 
455 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.42 
 
 
447 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.36 
 
 
224 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 
198 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  36.81 
 
 
274 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  33.48 
 
 
340 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.2 
 
 
231 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 
179 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  40.15 
 
 
442 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  40.74 
 
 
193 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  40.15 
 
 
456 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  40.88 
 
 
343 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.15 
 
 
442 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.15 
 
 
442 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.15 
 
 
442 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  40.15 
 
 
456 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
345 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 
345 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  44.27 
 
 
185 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 
345 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  42.34 
 
 
201 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  40.88 
 
 
311 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  40.15 
 
 
458 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.2 
 
 
205 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  40 
 
 
408 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  39.16 
 
 
195 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  37.82 
 
 
221 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.63 
 
 
196 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
190 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.58 
 
 
211 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  40.76 
 
 
198 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.49 
 
 
198 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 
340 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.76 
 
 
320 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  40.67 
 
 
253 aa  102  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 
198 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  40.52 
 
 
278 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.49 
 
 
198 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.26 
 
 
234 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  38.26 
 
 
234 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  39.6 
 
 
282 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 
229 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.11 
 
 
237 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.96 
 
 
209 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 
198 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>