287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 253 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  65.87 
 
 		 193 aa  215  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  65.92 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  55.33 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  63.74 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  58.01 
 
 		 191 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  60.89 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  64.12 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  53.7 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  59.66 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.36 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.59 
 
 		 224 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  56.85 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.27 
 
 		 205 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  49.58 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.03 
 
 		 221 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  52.5 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  58.24 
 
 		 224 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.98 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.61 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.41 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  61.49 
 
 		 191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  53.67 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.32 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  53.67 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  53.67 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.8 
 
 		 320 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  54.34 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  51.61 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.04 
 
 		 208 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  52.02 
 
 		 241 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  55.49 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  58.23 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.03 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.55 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  42.69 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.05 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  48.19 
 
 		 195 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 352 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  41.77 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.77 
 
 		 387 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  41.77 
 
 		 387 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 		 284 aa  115  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.33 
 
 		 534 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.33 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  42.29 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.15 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  41.1 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  45 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.26 
 
 		 192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.88 
 
 		 193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  36.14 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  38.61 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  43.37 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 206 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  32.75 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  45.29 
 
 		 184 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  40.67 
 
 		 353 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  38.27 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.1 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  43.86 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  33.72 
 
 		 183 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.46 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  30.49 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 190 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  29.88 
 
 		 195 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  34.95 
 
 		 195 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  39.29 
 
 		 178 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.88 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  37.99 
 
 		 209 aa  99.4  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  39.67 
 
 		 194 aa  99.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 171 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.29 
 
 		 187 aa  98.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  38.8 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.39 
 
 		 190 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  40.25 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  27.54 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  43.02 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  36.97 
 
 		 190 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.97 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  43.29 
 
 		 187 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.43 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  37.42 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1016  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.77 
 
 		 194 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  37.95 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  29.03 
 
 		 198 aa  96.3  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 189 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 190 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 190 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 		 190 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  38.73 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 340 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 345 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>