289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0239 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.43 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.49 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.98 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  51.24 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.23 
 
 		 196 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  54.7 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.07 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.3 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.91 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  55.81 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  52.46 
 
 		 193 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.28 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  50.58 
 
 		 282 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  42.06 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  50.58 
 
 		 191 aa  164  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  48.85 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.58 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.14 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  52.35 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  50.92 
 
 		 191 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.67 
 
 		 279 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  47.13 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  47.62 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  45.98 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  46.55 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  46.63 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.35 
 
 		 193 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  43.86 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  49.07 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  43.27 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  43.27 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  41.45 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.4 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.2 
 
 		 269 aa  128  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.56 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.34 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  40.46 
 
 		 284 aa  121  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.63 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.07 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  46.84 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  43.02 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  42.61 
 
 		 201 aa  105  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  39.53 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  40.46 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  45.16 
 
 		 187 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  39.41 
 
 		 181 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  37.84 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  31.52 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.78 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  36.78 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  35.54 
 
 		 183 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  41.01 
 
 		 206 aa  98.6  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.8 
 
 		 190 aa  98.2  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  35.12 
 
 		 190 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  33.73 
 
 		 198 aa  98.2  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.87 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.95 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 195 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  32.75 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.86 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  34.52 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  31.74 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.73 
 
 		 176 aa  96.3  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.64 
 
 		 195 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.83 
 
 		 196 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  39.05 
 
 		 408 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  39.05 
 
 		 394 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.25 
 
 		 196 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 340 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  36.63 
 
 		 178 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.1 
 
 		 340 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  36.84 
 
 		 184 aa  95.1  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 345 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 345 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  36.59 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.1 
 
 		 345 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.47 
 
 		 197 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.1 
 
 		 343 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  38.69 
 
 		 274 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  38.65 
 
 		 185 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  38.1 
 
 		 360 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  35.47 
 
 		 299 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.13 
 
 		 273 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>