287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1443 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  352  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.51 
 
 		 237 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  41.85 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.57 
 
 		 269 aa  115  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.07 
 
 		 252 aa  111  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  39.66 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.5 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  42.04 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.4 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 251 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.88 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  45.83 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  39.05 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  39.49 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.86 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.51 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.88 
 
 		 320 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.37 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  42.5 
 
 		 253 aa  97.1  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  40.13 
 
 		 282 aa  97.1  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  44 
 
 		 238 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  40.88 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  37.8 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  38.86 
 
 		 284 aa  96.3  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.21 
 
 		 220 aa  95.9  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.99 
 
 		 254 aa  95.5  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  40.69 
 
 		 372 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.69 
 
 		 387 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  31.68 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40 
 
 		 387 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.85 
 
 		 224 aa  94.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 352 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  38.65 
 
 		 238 aa  94.4  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 243 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.4 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.27 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  38.06 
 
 		 274 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  36.81 
 
 		 231 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  36.2 
 
 		 231 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  36.2 
 
 		 231 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  35.22 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 241 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.66 
 
 		 224 aa  88.6  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 		 299 aa  88.2  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.86 
 
 		 221 aa  87.8  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  37.27 
 
 		 252 aa  87.8  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  34.64 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.01 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.26 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  31.21 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  34.64 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.88 
 
 		 279 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  32.2 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  33.95 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.22 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  36.2 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  35.19 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.95 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.25 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.95 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.41 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  37.42 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  29.34 
 
 		 282 aa  81.3  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  26.54 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  28.66 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.9 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  40.67 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  34.97 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.16 
 
 		 534 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  32.48 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.91 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.13 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  32.93 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  33.14 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.97 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  31.33 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  37.35 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  31.61 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  28.65 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.77 
 
 		 447 aa  74.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.47 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  30.06 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  28.48 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.37 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  28.4 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.94 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  28.57 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  34.66 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.74 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>