278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2818 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  100 
 
 
229 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  72.02 
 
 
231 aa  275  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  71.5 
 
 
231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  71.5 
 
 
231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  66.51 
 
 
241 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  67.34 
 
 
231 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  61.43 
 
 
243 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  68.75 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  70.22 
 
 
193 aa  241  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  64.71 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  64.07 
 
 
252 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  61.05 
 
 
282 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  60.47 
 
 
191 aa  208  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.79 
 
 
279 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.47 
 
 
205 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  54 
 
 
241 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  59.02 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.18 
 
 
220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.15 
 
 
196 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  58.08 
 
 
185 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.78 
 
 
224 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.49 
 
 
261 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  53.55 
 
 
251 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  59.26 
 
 
253 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.08 
 
 
224 aa  185  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.6 
 
 
320 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  56.9 
 
 
191 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  51.4 
 
 
205 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.21 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.17 
 
 
221 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 
229 aa  165  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  45.83 
 
 
238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50 
 
 
208 aa  164  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  45.28 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  53.53 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.93 
 
 
225 aa  132  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.48 
 
 
269 aa  131  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.56 
 
 
187 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  42.94 
 
 
195 aa  121  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  38.69 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.77 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  35.62 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 
284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
179 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 
181 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.5 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.51 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.61 
 
 
189 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  33.85 
 
 
282 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.82 
 
 
178 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
190 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 
236 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 
352 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
190 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
190 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
190 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
190 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
190 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  33.73 
 
 
190 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  40.53 
 
 
221 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  34.52 
 
 
192 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.71 
 
 
192 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 
206 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  33.14 
 
 
190 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.95 
 
 
200 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  35.8 
 
 
387 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  35.37 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 
299 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  34.59 
 
 
190 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  33.14 
 
 
190 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.19 
 
 
196 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.7 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  33.13 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 
210 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  31.05 
 
 
195 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  36.42 
 
 
194 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  37.8 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  35.87 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  34.57 
 
 
372 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.57 
 
 
387 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  35.98 
 
 
195 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.14 
 
 
176 aa  95.9  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  32.56 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  35.47 
 
 
256 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  37.34 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  37.5 
 
 
184 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  37.43 
 
 
287 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 
394 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  38.74 
 
 
180 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  34.15 
 
 
206 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.16 
 
 
173 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.43 
 
 
190 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  40 
 
 
274 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  31.98 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  31.53 
 
 
199 aa  92.8  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>