275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1563 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
254 aa  491  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  66.67 
 
 
224 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.21 
 
 
220 aa  231  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  65.15 
 
 
224 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.96 
 
 
221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  52.11 
 
 
229 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  55.98 
 
 
238 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.62 
 
 
261 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  56.25 
 
 
193 aa  185  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.9 
 
 
252 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  51.83 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  56.32 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  54.29 
 
 
252 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  47.73 
 
 
243 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  53.45 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.84 
 
 
208 aa  178  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  53.45 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  61.36 
 
 
191 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.12 
 
 
193 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  54.59 
 
 
205 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  53.4 
 
 
241 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.56 
 
 
196 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.82 
 
 
224 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  52.57 
 
 
231 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  53.14 
 
 
231 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.55 
 
 
320 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  55.33 
 
 
253 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  51.38 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  51.67 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  54.76 
 
 
185 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  57.39 
 
 
238 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.94 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.93 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.29 
 
 
205 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.95 
 
 
225 aa  148  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  50 
 
 
229 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.33 
 
 
193 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  45.73 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.85 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
181 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.59 
 
 
189 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
171 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  35.83 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  33.9 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  37.72 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 
190 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 
190 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  34.46 
 
 
190 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.16 
 
 
534 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.58 
 
 
192 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  36.97 
 
 
192 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  45.28 
 
 
274 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 
206 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  33.9 
 
 
190 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  33.9 
 
 
190 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  33.9 
 
 
190 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  33.9 
 
 
190 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  35.33 
 
 
190 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  37.29 
 
 
195 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  34.1 
 
 
198 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 
387 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 
372 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  35.03 
 
 
190 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  41.62 
 
 
194 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  39.51 
 
 
387 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  43.64 
 
 
394 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  34.09 
 
 
190 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 
273 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.5 
 
 
222 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.72 
 
 
187 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  36.57 
 
 
318 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  35.39 
 
 
199 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.21 
 
 
196 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  38.65 
 
 
209 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  36.97 
 
 
195 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  36.87 
 
 
284 aa  102  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  43.03 
 
 
408 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  43.02 
 
 
184 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  42.77 
 
 
184 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.11 
 
 
196 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  42.44 
 
 
442 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  42.44 
 
 
442 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  42.44 
 
 
442 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  42.44 
 
 
442 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  43.38 
 
 
353 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  38.04 
 
 
209 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  44.24 
 
 
263 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 
221 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  41.67 
 
 
302 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  41.32 
 
 
255 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  41.07 
 
 
311 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  41.86 
 
 
458 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  41.32 
 
 
257 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  41.86 
 
 
456 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  41.86 
 
 
455 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  41.86 
 
 
456 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.33 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.52 
 
 
176 aa  98.6  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
360 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  40.11 
 
 
340 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>