281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.6 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  65.15 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.89 
 
 		 220 aa  217  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  53.21 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.64 
 
 		 252 aa  207  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.08 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  58.66 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60.34 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  58.48 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  57.95 
 
 		 193 aa  191  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  59.02 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  57.14 
 
 		 185 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  60.95 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.03 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  54.7 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  55.69 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.36 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  54.82 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  59.76 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.76 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  52.91 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.56 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.58 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  59.3 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  57.59 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.4 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  49.73 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  49.73 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  48.77 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  49.2 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  48.17 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.55 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  49.38 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.13 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  39.01 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.76 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.42 
 
 		 269 aa  121  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.11 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  47.27 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  43.68 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.11 
 
 		 189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  39.63 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.63 
 
 		 387 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  45 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  39.02 
 
 		 387 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 		 193 aa  105  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 		 179 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  35.68 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.1 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.44 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  38.29 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.92 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  35.23 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  33.52 
 
 		 282 aa  99.8  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  44.62 
 
 		 353 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 352 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  38.33 
 
 		 192 aa  98.6  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  33.12 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.13 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 		 185 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  27.37 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.88 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  40.24 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  34.86 
 
 		 190 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.74 
 
 		 447 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.1 
 
 		 534 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.82 
 
 		 196 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  33.71 
 
 		 190 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  33.71 
 
 		 190 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  34.29 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 180 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  34.29 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  34.29 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  34.29 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  34.29 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.04 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  34.29 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.1 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  38.29 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  37.04 
 
 		 195 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  38.15 
 
 		 259 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.22 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  36.91 
 
 		 199 aa  92  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  34.29 
 
 		 190 aa  91.7  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  36.22 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  33.89 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  37.57 
 
 		 277 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  37.27 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.27 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  33.75 
 
 		 171 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.97 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>