277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7248 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 447 aa  859    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  45.29 
 
 		 237 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 213 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  41.28 
 
 		 201 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  35.67 
 
 		 221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  39.66 
 
 		 202 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  39.18 
 
 		 206 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.41 
 
 		 534 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 		 211 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  37.95 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  35.29 
 
 		 299 aa  119  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  39.11 
 
 		 193 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  36.65 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  34.44 
 
 		 243 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 224 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  39.67 
 
 		 193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  38.01 
 
 		 195 aa  113  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.26 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  36.93 
 
 		 284 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  39.75 
 
 		 264 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  36.26 
 
 		 201 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.36 
 
 		 192 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.94 
 
 		 196 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  37.21 
 
 		 256 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 255 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  34.62 
 
 		 291 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  36.87 
 
 		 332 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  37.21 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  36.16 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  35.36 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  45.61 
 
 		 183 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.16 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  34.74 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  40.28 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  35.75 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  43.28 
 
 		 171 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  52.73 
 
 		 198 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 273 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  34.74 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.76 
 
 		 222 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  38.14 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  40.83 
 
 		 197 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  43.85 
 
 		 190 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 		 221 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  32.3 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  33.03 
 
 		 263 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  35.43 
 
 		 195 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 		 228 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  34.86 
 
 		 195 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  35.67 
 
 		 195 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  35.47 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  39.71 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  51.82 
 
 		 190 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  51.82 
 
 		 190 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  51.82 
 
 		 190 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  41.41 
 
 		 195 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  51.82 
 
 		 190 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 		 241 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.31 
 
 		 189 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.21 
 
 		 190 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  51.4 
 
 		 190 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  44.36 
 
 		 190 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  47.01 
 
 		 190 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  44.36 
 
 		 190 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  47.01 
 
 		 190 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  39.08 
 
 		 194 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  34.48 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.22 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  51.82 
 
 		 190 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  37.22 
 
 		 209 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.08 
 
 		 196 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 250 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 254 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  34.62 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.64 
 
 		 197 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.26 
 
 		 193 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  35.06 
 
 		 224 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 171 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 		 226 aa  99.8  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 185 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  33.53 
 
 		 212 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  42.11 
 
 		 199 aa  99.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  35.6 
 
 		 198 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  41.32 
 
 		 210 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  34.24 
 
 		 184 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 168 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  35.6 
 
 		 198 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  35.6 
 
 		 198 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  35.6 
 
 		 198 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  36.93 
 
 		 197 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>