277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3021 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  100 
 
 
318 aa  627  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  34.35 
 
 
299 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.78 
 
 
282 aa  123  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  43.57 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  48.57 
 
 
195 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  46.15 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.51 
 
 
192 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.37 
 
 
173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  43.51 
 
 
192 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.15 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  46.61 
 
 
221 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  45.26 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  52.94 
 
 
199 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  45.26 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.32 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.72 
 
 
196 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  52.73 
 
 
264 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.85 
 
 
534 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 
193 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 
179 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  40.27 
 
 
190 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.29 
 
 
195 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  42.65 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  37.41 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  47.33 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  42.65 
 
 
442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  42.65 
 
 
442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  37.22 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.04 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  42.65 
 
 
442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  36.89 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  42.65 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  42.86 
 
 
190 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  42.65 
 
 
442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  42.65 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  45.04 
 
 
221 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  42.65 
 
 
455 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  42.65 
 
 
340 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  42.96 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  41.91 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  49.56 
 
 
190 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  42.65 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  46.56 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  42.22 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 
250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.66 
 
 
195 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  50.91 
 
 
255 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  38.1 
 
 
209 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  42.96 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  50.91 
 
 
257 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  49.55 
 
 
259 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  43.59 
 
 
399 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  42.96 
 
 
311 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  43.85 
 
 
236 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  38.1 
 
 
209 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.96 
 
 
389 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 
206 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.61 
 
 
228 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  42.75 
 
 
287 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  42.96 
 
 
302 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  34.41 
 
 
353 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  41.48 
 
 
394 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  48.72 
 
 
263 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.48 
 
 
222 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  46.4 
 
 
200 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.9 
 
 
273 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  48.18 
 
 
337 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  41.3 
 
 
360 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  42.98 
 
 
201 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  43.08 
 
 
221 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 
213 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.37 
 
 
193 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  42.74 
 
 
291 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  39.26 
 
 
224 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.71 
 
 
447 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  43.85 
 
 
210 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  47.75 
 
 
256 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 
254 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  47.27 
 
 
247 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  41.04 
 
 
206 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  40.46 
 
 
197 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  46.85 
 
 
255 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  41.03 
 
 
195 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  44.95 
 
 
196 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  41.45 
 
 
201 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  38.85 
 
 
244 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  38.58 
 
 
274 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  43.07 
 
 
178 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 
254 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>