286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1005 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  100 
 
 
196 aa  393  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  50.82 
 
 
199 aa  187  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  48.57 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  43.01 
 
 
201 aa  165  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  44.15 
 
 
193 aa  160  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  43.37 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.81 
 
 
273 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  43.18 
 
 
190 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  43.96 
 
 
190 aa  141  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  43.96 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  42.78 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  42.78 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  42.78 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  42.78 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  42.78 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  42.78 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  37.3 
 
 
199 aa  137  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  42.78 
 
 
190 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  43.18 
 
 
190 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.69 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  43.2 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  42.6 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.55 
 
 
211 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  36.14 
 
 
198 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.04 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  41.32 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  37.35 
 
 
243 aa  111  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  36.97 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.65 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 
181 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.67 
 
 
196 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 
184 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.13 
 
 
206 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.26 
 
 
176 aa  106  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 
168 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  36.13 
 
 
221 aa  104  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  44.23 
 
 
282 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 
213 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  33.12 
 
 
189 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  43.44 
 
 
171 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  44.95 
 
 
318 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.34 
 
 
252 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  30.98 
 
 
241 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  44.63 
 
 
206 aa  101  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 
238 aa  101  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  39.75 
 
 
353 aa  101  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  37.36 
 
 
299 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 
237 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.52 
 
 
205 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  42.96 
 
 
226 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 
190 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  37.14 
 
 
284 aa  99.4  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  35.22 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.3 
 
 
224 aa  98.6  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  35.85 
 
 
388 aa  98.6  5e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  32.61 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  36.18 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.64 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  34.94 
 
 
274 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  42.25 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  32.98 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  44.74 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.02 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.27 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.63 
 
 
534 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  40.69 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  39.23 
 
 
252 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  40.69 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  40.69 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  40.69 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  38.97 
 
 
254 aa  95.5  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  40.6 
 
 
250 aa  95.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  38.97 
 
 
247 aa  95.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  40.12 
 
 
197 aa  94.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.69 
 
 
228 aa  94.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  42.54 
 
 
198 aa  94.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 
352 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.53 
 
 
201 aa  94.7  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.54 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  42.54 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  42.54 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  42.54 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  41.67 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  34.97 
 
 
197 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  40 
 
 
241 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  39.2 
 
 
243 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  37.6 
 
 
231 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.68 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.86 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  34.57 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  35.85 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  39.07 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  31.74 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  41.03 
 
 
282 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>