294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0688 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  59.01 
 
 		 190 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  44.91 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  44.94 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  45.61 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  45.11 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  43.2 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  43.31 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  43.03 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.21 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.5 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  39.63 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.69 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.42 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.42 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.78 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  38.92 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.63 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  39.62 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  39.52 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  38.17 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.24 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  39.24 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  37.95 
 
 		 284 aa  124  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  123  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  39.49 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  36.41 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  33.71 
 
 		 387 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  33.16 
 
 		 372 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.16 
 
 		 387 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.77 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  36.32 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 		 193 aa  117  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.27 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  34.59 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  35.52 
 
 		 352 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.32 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  36.14 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  38.61 
 
 		 274 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  39.24 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  35.33 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  39.57 
 
 		 353 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.36 
 
 		 534 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  34 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.54 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  34.85 
 
 		 237 aa  111  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  36.31 
 
 		 388 aa  109  3e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.06 
 
 		 447 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 		 299 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  37.42 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  34.21 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.53 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.2 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  35.2 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.1 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  36 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  33.13 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  36.96 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  34.39 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.54 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  32.53 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.76 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  35.26 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  34.2 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  33.73 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  32.53 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  32.53 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  34.09 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  31.79 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  34.36 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  34.36 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  39.51 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  41.96 
 
 		 318 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  31.98 
 
 		 349 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.48 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  35.39 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  35.39 
 
 		 247 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  35.86 
 
 		 442 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  35.86 
 
 		 458 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  35.86 
 
 		 442 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 340 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 345 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>