286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0722 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  54.55 
 
 		 243 aa  211  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.89 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  48.51 
 
 		 284 aa  192  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.7 
 
 		 252 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  48.85 
 
 		 191 aa  161  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  45.7 
 
 		 205 aa  161  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  49.7 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  50.3 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.73 
 
 		 196 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.12 
 
 		 320 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.67 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  47.73 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.26 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  46.33 
 
 		 282 aa  151  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.57 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  46.11 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.76 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.95 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  47.34 
 
 		 193 aa  148  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  44.32 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.62 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  49.37 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.71 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.59 
 
 		 279 aa  141  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  45.16 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 241 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.44 
 
 		 193 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  42.13 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  48.7 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  40.54 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  40.54 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  40.54 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  41.85 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 183 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  45.4 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  43.02 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.43 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  40.1 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  49.62 
 
 		 353 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  42.29 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.2 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.25 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  37.69 
 
 		 387 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  40.59 
 
 		 352 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  37.19 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.19 
 
 		 387 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 282 aa  121  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  40.85 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.94 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  40.35 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.88 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  33.72 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 190 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 190 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 190 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 190 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 190 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.18 
 
 		 187 aa  118  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  38.12 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.12 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.59 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  40.44 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.75 
 
 		 179 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  47.65 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  40 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.57 
 
 		 534 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.32 
 
 		 197 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  44.31 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.32 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.9 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  34.32 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  40.85 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  35 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  36.52 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44 
 
 		 173 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  35.96 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  34.47 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  39.67 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.44 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  40.57 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  39.24 
 
 		 190 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.52 
 
 		 389 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  36.87 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  34.15 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.7 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  36.63 
 
 		 280 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.5 
 
 		 176 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>