276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2456 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 320 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  67.93 
 
 		 185 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.3 
 
 		 252 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  69.28 
 
 		 196 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.07 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  61.02 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  59.78 
 
 		 193 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  55.17 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.71 
 
 		 224 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  61.33 
 
 		 251 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.33 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  54.79 
 
 		 252 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  60.84 
 
 		 191 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  58.1 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.3 
 
 		 193 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  53.85 
 
 		 231 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  56.42 
 
 		 231 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  56.42 
 
 		 231 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  57.8 
 
 		 205 aa  198  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  56.74 
 
 		 231 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.3 
 
 		 205 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.69 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  57.54 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  51.3 
 
 		 229 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.56 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  61.01 
 
 		 191 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  58.33 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.58 
 
 		 221 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  55.56 
 
 		 224 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.55 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  50.28 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  59.76 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.98 
 
 		 237 aa  170  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  53.7 
 
 		 229 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.55 
 
 		 225 aa  157  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.25 
 
 		 208 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.91 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  42.2 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  42.78 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.01 
 
 		 237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 206 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  32.34 
 
 		 237 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  32.51 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  36.25 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  42.76 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.88 
 
 		 197 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.37 
 
 		 192 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 184 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  36.72 
 
 		 206 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 190 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  37.08 
 
 		 190 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.36 
 
 		 193 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.64 
 
 		 211 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  36.52 
 
 		 190 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.79 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.46 
 
 		 189 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  40.37 
 
 		 185 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  35.37 
 
 		 192 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.11 
 
 		 187 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 190 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.26 
 
 		 196 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  34.97 
 
 		 201 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 		 171 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.35 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.8 
 
 		 387 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  35.19 
 
 		 387 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  37.8 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  36.2 
 
 		 195 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.33 
 
 		 222 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 213 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  31.4 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.74 
 
 		 176 aa  95.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  39.58 
 
 		 190 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  38.15 
 
 		 194 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  35.52 
 
 		 195 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 210 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.63 
 
 		 184 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  34.24 
 
 		 195 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.26 
 
 		 200 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  39.88 
 
 		 198 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 		 198 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 		 198 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 		 198 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.92 
 
 		 196 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.69 
 
 		 221 aa  92.8  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  36.47 
 
 		 352 aa  92.4  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.64 
 
 		 198 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>