277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0975 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 224 aa  440  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  83.71 
 
 		 193 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  68.72 
 
 		 252 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  70 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  68.05 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  66.27 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  60.8 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  60.8 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.71 
 
 		 320 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.21 
 
 		 261 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  62.36 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.67 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.76 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  64.81 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  60.8 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  59.32 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  52.85 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.44 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  58.14 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  52.22 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  55.88 
 
 		 193 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  60.78 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  55.37 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  60.12 
 
 		 191 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.31 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  56.07 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  52.81 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  52.81 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  52.81 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  54.91 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  58.54 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.94 
 
 		 205 aa  168  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  49.14 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.2 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.78 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.71 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.2 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  40.34 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  40.59 
 
 		 284 aa  123  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  44.17 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.86 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.24 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.87 
 
 		 193 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  42.76 
 
 		 353 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.79 
 
 		 387 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.04 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 		 387 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  37.58 
 
 		 352 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.61 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.34 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.51 
 
 		 534 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  28.65 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  39.75 
 
 		 456 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  39.75 
 
 		 456 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  39.75 
 
 		 455 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  39.75 
 
 		 458 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.42 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.79 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  40.37 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  39.39 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.29 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.41 
 
 		 343 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.48 
 
 		 179 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  38.3 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  37.42 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  36.9 
 
 		 178 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 		 280 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  35.62 
 
 		 190 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 345 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.41 
 
 		 349 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 345 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.41 
 
 		 345 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 		 442 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 		 442 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 		 442 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 		 442 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  35 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.41 
 
 		 340 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.51 
 
 		 389 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 340 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  35.62 
 
 		 190 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  37.89 
 
 		 304 aa  98.2  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  39.13 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  37.8 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.6 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.88 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  40 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  34.38 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  34.38 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  35 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  35 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>