291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06810 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  100 
 
 
284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.52 
 
 
269 aa  262  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  60 
 
 
243 aa  234  9e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.51 
 
 
225 aa  192  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  47.4 
 
 
195 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  44.63 
 
 
191 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  46.15 
 
 
185 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  44.25 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.79 
 
 
196 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  41.18 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 
181 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  38.2 
 
 
205 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 
183 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  43.65 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.01 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  36.49 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.12 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.94 
 
 
192 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.11 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  38.92 
 
 
387 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.08 
 
 
196 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  43.53 
 
 
192 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.58 
 
 
197 aa  125  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.92 
 
 
387 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  38.92 
 
 
372 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.26 
 
 
273 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  37.95 
 
 
198 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 
205 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  43.83 
 
 
252 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 
171 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.77 
 
 
220 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  41.11 
 
 
195 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  40.11 
 
 
231 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.52 
 
 
224 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 
352 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  42.13 
 
 
195 aa  122  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  40.46 
 
 
238 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  39.13 
 
 
171 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 
189 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  43.02 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  40.57 
 
 
193 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  39.2 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  39.08 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.11 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  39.2 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.59 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
241 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.92 
 
 
193 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  40 
 
 
190 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  45.56 
 
 
197 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.69 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.29 
 
 
193 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  36.93 
 
 
201 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  39.75 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  39.75 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.92 
 
 
187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.69 
 
 
320 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 
208 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 
190 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  35.37 
 
 
189 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf011  segregation and condensation protein B  37.8 
 
 
206 aa  115  6e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 
190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 
190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 
190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 
190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 
190 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  37.42 
 
 
168 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  37.99 
 
 
206 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  38.51 
 
 
190 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  35.36 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  41.67 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.11 
 
 
534 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.58 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  41.14 
 
 
193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  40 
 
 
385 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  38.65 
 
 
253 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.39 
 
 
190 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.29 
 
 
447 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  34.81 
 
 
195 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  31.4 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 
188 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.81 
 
 
221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.9 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
198 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
198 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 
237 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.98 
 
 
198 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 
198 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 
194 aa  109  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  36.53 
 
 
224 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  33.14 
 
 
282 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  41.86 
 
 
287 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  34.22 
 
 
229 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  43.03 
 
 
189 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.42 
 
 
198 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  37.27 
 
 
190 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  35.23 
 
 
199 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>