294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2583 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  44.91 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.1 
 
 		 190 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  44.51 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  43.9 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 190 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  44.03 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.41 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  39.39 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.66 
 
 		 273 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.36 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.24 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  37.58 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  37.79 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  37.21 
 
 		 274 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  35.37 
 
 		 284 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.76 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  34.57 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.29 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.31 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  35.19 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  35.16 
 
 		 237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  38.51 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.41 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  31.32 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.5 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  38.26 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  35.44 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  32.14 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  36.48 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.54 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  33.12 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.77 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  34.57 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  33.12 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  35.85 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.74 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.73 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  36.42 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf011  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  36.15 
 
 		 318 aa  99  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  34.36 
 
 		 387 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 251 aa  98.2  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  34.5 
 
 		 352 aa  97.8  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.74 
 
 		 387 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.67 
 
 		 237 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  33.74 
 
 		 372 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  33.9 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  33.15 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0353  segregation and condensation protein B  29.82 
 
 		 388 aa  96.7  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.260202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  35.38 
 
 		 353 aa  96.3  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.93 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  35.8 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.09 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  30.67 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  37.42 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  34.34 
 
 		 239 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  29.79 
 
 		 299 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  34.97 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  35.47 
 
 		 221 aa  95.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  34.07 
 
 		 349 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  33.54 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  31.58 
 
 		 222 aa  94.4  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 243 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  35 
 
 		 229 aa  94.4  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  30.16 
 
 		 221 aa  94.4  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.59 
 
 		 165 aa  94.4  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  30.18 
 
 		 231 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  37.68 
 
 		 399 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.49 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  37.59 
 
 		 360 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  35.56 
 
 		 345 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  33.73 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 238 aa  92.8  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  28.99 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.14 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 345 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>