288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1467 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.16 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  42.21 
 
 
372 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  42.21 
 
 
387 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.21 
 
 
387 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  42 
 
 
352 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  41.14 
 
 
195 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.07 
 
 
189 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.8 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  43.05 
 
 
282 aa  119  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  40.76 
 
 
195 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  38.18 
 
 
237 aa  117  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.12 
 
 
273 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 
190 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  36.31 
 
 
209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.97 
 
 
209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  40.13 
 
 
215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.65 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  36.31 
 
 
209 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  43.4 
 
 
190 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  43.4 
 
 
190 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  43.4 
 
 
190 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  42.14 
 
 
190 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  43.4 
 
 
190 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  43.4 
 
 
190 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  37.42 
 
 
274 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  38.99 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  36.65 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 
190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  39.35 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40.65 
 
 
299 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.31 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.18 
 
 
231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.56 
 
 
534 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  38.85 
 
 
385 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.35 
 
 
193 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.89 
 
 
179 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  35.67 
 
 
198 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  41.29 
 
 
190 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  37.75 
 
 
195 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  39.74 
 
 
187 aa  104  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  38.56 
 
 
239 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.34 
 
 
174 aa  103  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.02 
 
 
222 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  35.8 
 
 
198 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  35.8 
 
 
198 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  35.8 
 
 
198 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  37.09 
 
 
206 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 
185 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 
190 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  34.32 
 
 
198 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 
245 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.79 
 
 
197 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.65 
 
 
198 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 
198 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 
198 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 
198 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 
198 aa  101  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  37.82 
 
 
221 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.1 
 
 
248 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  43.59 
 
 
190 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  34.84 
 
 
250 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  35.26 
 
 
198 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.46 
 
 
187 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  35.48 
 
 
198 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  36.42 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  38.85 
 
 
358 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 
256 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.85 
 
 
389 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 
213 aa  98.6  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  40 
 
 
189 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  40 
 
 
432 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1368  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.81 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.2 
 
 
211 aa  97.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  32.74 
 
 
206 aa  97.4  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  36.73 
 
 
243 aa  97.8  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 
242 aa  97.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 
248 aa  97.1  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.99 
 
 
206 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
197 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  35.95 
 
 
242 aa  97.1  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.09 
 
 
269 aa  96.3  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.22 
 
 
220 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 
221 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  95.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 
210 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  35.17 
 
 
212 aa  94.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  33.99 
 
 
221 aa  94.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  38.26 
 
 
241 aa  94.4  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  38.26 
 
 
241 aa  94.4  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  34.59 
 
 
189 aa  94.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  94  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 
254 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>