283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2512 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  79.51 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  80.24 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  80.72 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  80 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  82.33 
 
 		 248 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  79.76 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  58.48 
 
 		 242 aa  254  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  61.4 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  65.24 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  66.49 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  61.14 
 
 		 242 aa  231  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.4 
 
 		 220 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  58.9 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  58.9 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.71 
 
 		 238 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  58.99 
 
 		 238 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  65.46 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  56.87 
 
 		 242 aa  221  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  57.3 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  66.15 
 
 		 218 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  63.96 
 
 		 216 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  63.91 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  60.69 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  55.98 
 
 		 211 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  57.14 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  55.98 
 
 		 211 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  57.8 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  54.17 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  58.76 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  57.23 
 
 		 215 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  53.25 
 
 		 197 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  58.15 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  58.45 
 
 		 195 aa  165  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  51.18 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.02 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  45.4 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  42.37 
 
 		 399 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  40.57 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.58 
 
 		 534 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.24 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  40.11 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  39.43 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  41.49 
 
 		 201 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  39.55 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  40.85 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  43.5 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  40.85 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  40.96 
 
 		 178 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  35.81 
 
 		 226 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  40.12 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  41.18 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  41.18 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.86 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  41.18 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.59 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  42.59 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.1 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  41.36 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  40.99 
 
 		 343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  35.62 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40.94 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  40.99 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  40.99 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  40.99 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.48 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 198 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.34 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.14 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  40.21 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 458 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 456 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  37.89 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 		 184 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 455 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 456 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 360 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.07 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  39.51 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  39.39 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  42.24 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>