277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1762 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  87.9 
 
 		 248 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  84.28 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  81.89 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  81.56 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  80 
 
 		 358 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  82.33 
 
 		 256 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  55.17 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  60.55 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  63.5 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  65.75 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  63.13 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.38 
 
 		 220 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  61.17 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  61.17 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.46 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  56.4 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.38 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  54.03 
 
 		 242 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  56.54 
 
 		 211 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  58.1 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  62.38 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  62.72 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  57.3 
 
 		 211 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  56.76 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  61.22 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  59.54 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  57.23 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  56.57 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  57.83 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  55.85 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  55.73 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  52.07 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  59.26 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  49.41 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.73 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  44.83 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.66 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  42.55 
 
 		 201 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  33.79 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.64 
 
 		 534 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  42.29 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  41.48 
 
 		 399 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  40.34 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  43.27 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  42 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  41.61 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  41.46 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  41.61 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  41.61 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  41.61 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  41.61 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.85 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  40.96 
 
 		 178 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  40.21 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.15 
 
 		 198 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 349 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  35.68 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 442 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 442 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 458 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 442 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  39.64 
 
 		 360 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 442 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.1 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  37.38 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 455 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.1 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 		 198 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.8 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  41.88 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  41.36 
 
 		 198 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  41.36 
 
 		 198 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  41.36 
 
 		 198 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  41.36 
 
 		 198 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  36.65 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  43.04 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.92 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  40.99 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  40.36 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  40.24 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  40.12 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  39.63 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  40.57 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  42.86 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>