275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1368 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1368  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
177 aa  346  9e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.13 
 
 
209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.65 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.81 
 
 
165 aa  104  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.28 
 
 
189 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  36.88 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  34.05 
 
 
188 aa  94  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 
242 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  36.65 
 
 
198 aa  92.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 
198 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 
198 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 
198 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  90.9  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
197 aa  90.9  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.72 
 
 
273 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  30.73 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  31.55 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 
198 aa  87.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 
198 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.12 
 
 
198 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 
198 aa  87.4  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 
213 aa  87  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  29.82 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  29.03 
 
 
215 aa  85.5  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  33.75 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  31.68 
 
 
199 aa  84.7  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.07 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 
210 aa  84.3  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  34.78 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  32.5 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  27.22 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  27.85 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.85 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  32.52 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  28.35 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.3 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  28.66 
 
 
274 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  31.29 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  28.75 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.81 
 
 
196 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  33.53 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  31.1 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.23 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  29.05 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  33.94 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  31.33 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  33.33 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
352 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 
250 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  28.48 
 
 
284 aa  77.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30 
 
 
211 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  27.95 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.94 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  32.9 
 
 
226 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.48 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  27.81 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  28.66 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.7 
 
 
534 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  29.38 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.01 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  32.9 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf011  segregation and condensation protein B  35.19 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.72 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  29.71 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  30.32 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  31.18 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  30.43 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.89 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  30.06 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  31.03 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  30.77 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.73 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.91 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  31.29 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.77 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  30.95 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  26.28 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  26.99 
 
 
244 aa  72  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  31.01 
 
 
340 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  31.01 
 
 
345 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.52 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  31.65 
 
 
442 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  31.65 
 
 
442 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  31.01 
 
 
340 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  31.01 
 
 
345 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  31.65 
 
 
442 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>