276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0440 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  54.97 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  52.15 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  42.86 
 
 		 385 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  46.32 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  46.78 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  46.03 
 
 		 432 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  42.79 
 
 		 358 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  53.49 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  50 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  50 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  42.79 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  47.65 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  46.35 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  46.03 
 
 		 256 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3931  condensin subunit ScpB  57.14 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  45.03 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  50 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.26 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.34 
 
 		 534 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  46.47 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  48.54 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 211 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.75 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  40.48 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.63 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  44.24 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  44.69 
 
 		 206 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  41.41 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  44.25 
 
 		 195 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  38.46 
 
 		 195 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.32 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  42.37 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  47.06 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  37.28 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  41.57 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 		 201 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  47.67 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  40.56 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.55 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.42 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2319  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.62874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.24 
 
 		 197 aa  118  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  38.55 
 
 		 193 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  41.23 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40.46 
 
 		 299 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  44.91 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  37.95 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.18 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  43.2 
 
 		 352 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  39.16 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  39.16 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  39.16 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  39.16 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  36.19 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.55 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  43.27 
 
 		 372 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.27 
 
 		 387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.02 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  40.36 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.16 
 
 		 184 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  43.79 
 
 		 387 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  37.37 
 
 		 256 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  35.98 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  35.76 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.34 
 
 		 192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  35.76 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  35.09 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  36.84 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.48 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  36.31 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 455 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 456 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  37.02 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 456 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  45.45 
 
 		 349 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.18 
 
 		 165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  47.43 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>