291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1417 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  338  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  46.78 
 
 		 195 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  43.03 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.9 
 
 		 273 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.64 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.12 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  37.72 
 
 		 195 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  37.72 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.41 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.11 
 
 		 269 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  45.83 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.37 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  45.59 
 
 		 353 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 		 192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 243 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  44.12 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.57 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  44.12 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  41.92 
 
 		 284 aa  124  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 		 299 aa  123  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.35 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  38.32 
 
 		 237 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  39.31 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  44.12 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  40.12 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  44.71 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  44.71 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  38.89 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.18 
 
 		 225 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.13 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  44.71 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  44.71 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  43.2 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  44.12 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  43.2 
 
 		 190 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.1 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 		 250 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  39.18 
 
 		 206 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.39 
 
 		 254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  43.53 
 
 		 190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 		 198 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 		 205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  36.57 
 
 		 193 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 372 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  39.05 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.07 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.12 
 
 		 387 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  35.67 
 
 		 282 aa  114  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  36.57 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40.12 
 
 		 387 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.9 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  37.06 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.24 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  40.74 
 
 		 212 aa  111  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  39.05 
 
 		 209 aa  111  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.99 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  38.92 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.59 
 
 		 193 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.21 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  39.05 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  36.97 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 		 226 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.24 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  37.43 
 
 		 210 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.82 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  38.82 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  38.82 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  38.82 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  42.17 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  41.32 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 245 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.55 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  37.2 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 352 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 		 221 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  35.67 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 254 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 251 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  37.13 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.11 
 
 		 221 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  38.95 
 
 		 215 aa  104  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.88 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  39.51 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  38.27 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.07 
 
 		 447 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 274 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  43.44 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>