291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1300 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  390  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.99 
 
 		 192 aa  194  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  57.4 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  48.62 
 
 		 299 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  50.29 
 
 		 387 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  54.17 
 
 		 195 aa  177  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.33 
 
 		 534 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.71 
 
 		 387 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  49.71 
 
 		 372 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  50.86 
 
 		 352 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  54.71 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  53.57 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  48.54 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  43.02 
 
 		 282 aa  152  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.9 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  43.75 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  40.66 
 
 		 352 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.65 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  43.85 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.62 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  43.03 
 
 		 353 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  42.33 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  42.27 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.27 
 
 		 389 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  41.86 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  41.86 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  46.74 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  40.78 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  46.82 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  42.49 
 
 		 304 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  42.19 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  44.71 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 		 349 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.1 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  42.6 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  42.78 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  43.93 
 
 		 455 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  43.35 
 
 		 343 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  43.93 
 
 		 458 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  43.35 
 
 		 345 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  42.86 
 
 		 274 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  42.01 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  43.35 
 
 		 345 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 		 345 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 		 340 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  43.93 
 
 		 456 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  43.93 
 
 		 456 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  46.51 
 
 		 302 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  43.35 
 
 		 340 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  43.93 
 
 		 360 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  40.22 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 		 442 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 		 442 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 		 442 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 		 442 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  43.03 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  40 
 
 		 337 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  42.22 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  42.77 
 
 		 408 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  43.93 
 
 		 311 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.24 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 		 394 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  37.62 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  40.39 
 
 		 291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  43.35 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  41.45 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.29 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  42.29 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  41.58 
 
 		 287 aa  131  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 245 aa  131  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  42.78 
 
 		 330 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  39.44 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  47.65 
 
 		 284 aa  131  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  39.7 
 
 		 399 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  43.23 
 
 		 264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.29 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  42.19 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  41.15 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  36.96 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  42.6 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.1 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  43.1 
 
 		 332 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  43.68 
 
 		 263 aa  128  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  37.7 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.45 
 
 		 193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>