284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1690 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  63.24 
 
 		 195 aa  246  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  61.75 
 
 		 195 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  61.41 
 
 		 195 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.3 
 
 		 192 aa  207  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  56.76 
 
 		 192 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  59.02 
 
 		 189 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  52.41 
 
 		 299 aa  184  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.21 
 
 		 534 aa  165  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  50.87 
 
 		 387 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  50.6 
 
 		 372 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.6 
 
 		 387 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  50.59 
 
 		 352 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  40.46 
 
 		 352 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  43.5 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  43.45 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  41.24 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  41.4 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  41.24 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  42.61 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.5 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  39.31 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  39.43 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.05 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  42.14 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  37.63 
 
 		 399 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.86 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.69 
 
 		 231 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  37.13 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  34.83 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.89 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  36.99 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  38.37 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.02 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  35.39 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  40.72 
 
 		 408 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  38.02 
 
 		 343 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.42 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  40.72 
 
 		 345 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  39.55 
 
 		 340 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  38.98 
 
 		 360 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  40.72 
 
 		 345 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  38.42 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  38.42 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  40.72 
 
 		 345 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  38.42 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  40.72 
 
 		 340 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.98 
 
 		 349 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  39.2 
 
 		 442 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  39.2 
 
 		 442 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  39.2 
 
 		 442 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  34.66 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  39.2 
 
 		 442 aa  121  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.2 
 
 		 269 aa  121  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  40.36 
 
 		 456 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 455 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  35.92 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 456 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  33.33 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.98 
 
 		 458 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  34.86 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  36.53 
 
 		 171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  33.5 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  38.42 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 394 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  33.01 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  33.51 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.79 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  38.29 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  46.67 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  37.71 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.62 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 171 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  40.91 
 
 		 353 aa  118  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  37.57 
 
 		 330 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  35.9 
 
 		 221 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.89 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 247 aa  117  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.27 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 332 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  37.71 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  37.71 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.07 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  37.71 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  37.71 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  37.71 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  38.01 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>