295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1927 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  97.4 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  75.94 
 
 		 189 aa  264  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  66.3 
 
 		 195 aa  245  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  67.58 
 
 		 195 aa  228  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  57.92 
 
 		 195 aa  215  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  57.3 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  53.85 
 
 		 372 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.85 
 
 		 387 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  50 
 
 		 299 aa  181  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  52.66 
 
 		 387 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  51.41 
 
 		 352 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.07 
 
 		 534 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  58.48 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  45.68 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  47.27 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  43.02 
 
 		 222 aa  147  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  44.07 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.62 
 
 		 273 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.98 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  43.37 
 
 		 183 aa  141  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  40.8 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  46.63 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  39.77 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.96 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.92 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.28 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  38.98 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  43.93 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  38.98 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  39.53 
 
 		 287 aa  131  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  43.26 
 
 		 353 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  38.42 
 
 		 198 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  40.8 
 
 		 190 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 210 aa  130  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  41.28 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  38.95 
 
 		 352 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  39.78 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  41.28 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  41.28 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  38.37 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  41.28 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.43 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.28 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  40.8 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  38.17 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  43.37 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  41.42 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.78 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  37.23 
 
 		 256 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.29 
 
 		 206 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 255 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  39.08 
 
 		 277 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  43.67 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  41.07 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  41.07 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  41.07 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  41.07 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  41.07 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  39.89 
 
 		 337 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  39.88 
 
 		 399 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  39.77 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  42.94 
 
 		 284 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  38.6 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  38.15 
 
 		 311 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  37.71 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  38.86 
 
 		 291 aa  124  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  38.59 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  36.32 
 
 		 226 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  39.56 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.22 
 
 		 189 aa  124  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 280 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  39.77 
 
 		 264 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.43 
 
 		 389 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.37 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.37 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  39.66 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  36.84 
 
 		 304 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.69 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.94 
 
 		 225 aa  120  9e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  37.58 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  38.37 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  38.37 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  37.43 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>