289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1958 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  75.26 
 
 		 195 aa  293  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  72.43 
 
 		 189 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.58 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  66.48 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  63.78 
 
 		 195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  61.41 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  53.23 
 
 		 387 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  53.85 
 
 		 299 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  52.69 
 
 		 372 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.69 
 
 		 387 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  55.29 
 
 		 352 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50 
 
 		 534 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  54.12 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  43.01 
 
 		 282 aa  160  9e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  43.6 
 
 		 352 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  46.82 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  42.29 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  45.35 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  42.05 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.55 
 
 		 228 aa  141  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.62 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  41.04 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  41.04 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  42.11 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  42.11 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  42.56 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  41.04 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.9 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  40.57 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  42.13 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 		 256 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  41.86 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.91 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  37.84 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  42.44 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  40.68 
 
 		 291 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  39.31 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  40.7 
 
 		 337 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  40.35 
 
 		 399 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  39.31 
 
 		 277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.65 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  38.15 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  40.11 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  39.78 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  40.12 
 
 		 257 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 		 330 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  44.79 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  37.57 
 
 		 263 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.41 
 
 		 211 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  39.55 
 
 		 246 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  42.07 
 
 		 190 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  41.72 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.57 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  39.77 
 
 		 332 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  40.94 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  38.79 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  41.01 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  41.01 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  41.01 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  41.01 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.74 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  41.01 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  42.07 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  40.12 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  42.42 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  38.42 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.51 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  39.18 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  36.55 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  39.18 
 
 		 247 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  41.82 
 
 		 442 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  41.82 
 
 		 456 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  41.82 
 
 		 455 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  41.82 
 
 		 458 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  41.21 
 
 		 408 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  39.89 
 
 		 340 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  41.82 
 
 		 442 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  41.82 
 
 		 456 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  42.42 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  39.89 
 
 		 340 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  39.89 
 
 		 345 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  41.82 
 
 		 442 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>