295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1884 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  100 
 
 
195 aa  387  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  63.24 
 
 
206 aa  246  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  61.9 
 
 
195 aa  232  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  64.13 
 
 
195 aa  222  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.92 
 
 
192 aa  215  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  56.91 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  60.43 
 
 
189 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  51.18 
 
 
534 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  49.71 
 
 
299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  52.2 
 
 
387 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  51.87 
 
 
352 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  50.83 
 
 
372 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.83 
 
 
387 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  43.82 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  52.94 
 
 
200 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 
198 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  43.43 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  42.05 
 
 
352 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
282 aa  146  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  45.03 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  42.5 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  43.98 
 
 
183 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  44.19 
 
 
226 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  41.86 
 
 
210 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  40.12 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  43.03 
 
 
250 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 
209 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  41.01 
 
 
194 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  41.67 
 
 
291 aa  137  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.51 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  41.14 
 
 
198 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.86 
 
 
206 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  41.14 
 
 
198 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  41.14 
 
 
198 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  41.14 
 
 
198 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.25 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  40.11 
 
 
277 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  40.11 
 
 
255 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  39.56 
 
 
257 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  36.96 
 
 
193 aa  134  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  40 
 
 
287 aa  134  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  39.33 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  42.33 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  39.43 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 
245 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  38.37 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  41.42 
 
 
201 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  39.11 
 
 
259 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  39.08 
 
 
197 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 
198 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  39.18 
 
 
263 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.57 
 
 
198 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 
198 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
221 aa  131  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 
198 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 
198 aa  131  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  42.86 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  38.46 
 
 
337 aa  130  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  37.79 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  45.83 
 
 
171 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  38.97 
 
 
264 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.08 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  35.71 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  35.87 
 
 
311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.52 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  39.04 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  35.16 
 
 
280 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  39.89 
 
 
399 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  40.49 
 
 
408 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.16 
 
 
389 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.71 
 
 
269 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  35.15 
 
 
343 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  37.87 
 
 
302 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 
349 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 
345 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
345 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.7 
 
 
187 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
345 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.6 
 
 
340 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
340 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  42.29 
 
 
190 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
360 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  38.2 
 
 
237 aa  124  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.24 
 
 
273 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  37.71 
 
 
178 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
254 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  37.23 
 
 
247 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  38.32 
 
 
171 aa  123  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  42.05 
 
 
190 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  35.2 
 
 
442 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  42.05 
 
 
284 aa  123  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  39.26 
 
 
394 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  38.01 
 
 
458 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  41.14 
 
 
190 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  35.2 
 
 
442 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  35.2 
 
 
442 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  41.38 
 
 
243 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  42.05 
 
 
190 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>