297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2059 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  98.97 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  44.51 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  45.61 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.68 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  46.63 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  47.19 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  47.19 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  47.19 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  47.19 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  47.19 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  46.63 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  45.6 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  47.19 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  46.63 
 
 		 190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  46.07 
 
 		 190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  43.9 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.43 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  46.63 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.81 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  42.17 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  39.78 
 
 		 282 aa  141  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.43 
 
 		 273 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  45.45 
 
 		 199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  41.38 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44 
 
 		 534 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  44.1 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.94 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.79 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40.56 
 
 		 387 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  38.29 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.35 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  40 
 
 		 372 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  39.47 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 387 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 		 171 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 352 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  42.6 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.78 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.71 
 
 		 269 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.12 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  36.65 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  40.62 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.46 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  34.66 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  43.45 
 
 		 194 aa  121  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  37.21 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.11 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.69 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.08 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  37.95 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  37.95 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  37.95 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  37.95 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  38.24 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  38.79 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  35.26 
 
 		 274 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.95 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  37.14 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.88 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  34.48 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  34.64 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  42.6 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  33.82 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  44.85 
 
 		 353 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  35.62 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 245 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  35.98 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  36.36 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  34.81 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.52 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  38.73 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.22 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  34.66 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  39.33 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.75 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.5 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  35.39 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  38.69 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  34.07 
 
 		 385 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  34.1 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.75 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.27 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  38.1 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  32.76 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  34.52 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  33.71 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>