290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1831 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  75.26 
 
 		 195 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  66.3 
 
 		 192 aa  245  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  65.22 
 
 		 192 aa  244  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  61.9 
 
 		 195 aa  232  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  61.75 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  66.48 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  56.14 
 
 		 387 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  56.98 
 
 		 372 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.98 
 
 		 387 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.76 
 
 		 534 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  54.1 
 
 		 352 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  50.3 
 
 		 299 aa  177  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  46.88 
 
 		 282 aa  151  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  47.4 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  46.03 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.81 
 
 		 222 aa  140  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.18 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  39.13 
 
 		 352 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  41.95 
 
 		 195 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2690  segregation and condensation protein B  42.56 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  43.89 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  41.38 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  41.18 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  42.44 
 
 		 259 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  42.44 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  42.55 
 
 		 255 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  43.79 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  41.86 
 
 		 256 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  39.69 
 
 		 209 aa  131  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  42.44 
 
 		 277 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  42.46 
 
 		 257 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  40.12 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 250 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  39.53 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  42.77 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  38.04 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  39.69 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  39.46 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.14 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  40.76 
 
 		 221 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00872  segregation and condensation protein B, putative  41.18 
 
 		 399 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  41.27 
 
 		 263 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  39.13 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  38.67 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  43.6 
 
 		 264 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 		 245 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 330 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  38.07 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.25 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 210 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.75 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  41.57 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  39.31 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.86 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  38.6 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  40.31 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  38.78 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  36.41 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  40.31 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  40.31 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  41.28 
 
 		 332 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.31 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  40.74 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  36.6 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  42.13 
 
 		 284 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  38.25 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  38.78 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  38.78 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  38.78 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.76 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  41.26 
 
 		 353 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  41.4 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  38.82 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.04 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.76 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  44.83 
 
 		 273 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.77 
 
 		 196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.42 
 
 		 269 aa  118  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  41.92 
 
 		 215 aa  117  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  38.07 
 
 		 349 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  38.07 
 
 		 340 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 340 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  38.07 
 
 		 345 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  37.43 
 
 		 343 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 345 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  38.07 
 
 		 345 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  35.96 
 
 		 311 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 		 442 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 		 442 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>