282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0440 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  65.84 
 
 
201 aa  267  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  57.81 
 
 
213 aa  223  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  54.27 
 
 
221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  53.57 
 
 
202 aa  205  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  54.82 
 
 
224 aa  201  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.46 
 
 
211 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  37.23 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  42.24 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36 
 
 
447 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.31 
 
 
195 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  37.72 
 
 
195 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  38.29 
 
 
243 aa  118  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  38.36 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.11 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  37.57 
 
 
299 aa  118  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.41 
 
 
534 aa  118  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  37.95 
 
 
195 aa  117  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  38.42 
 
 
372 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  37.85 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.42 
 
 
387 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 
190 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.37 
 
 
187 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  37.85 
 
 
387 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  38.64 
 
 
190 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  36.88 
 
 
195 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  38.8 
 
 
190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  36.88 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.33 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  37.79 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  38.25 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  38.15 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
189 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35 
 
 
225 aa  113  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.06 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 
171 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  37.21 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37 
 
 
273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  39.29 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  34.64 
 
 
352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  39.66 
 
 
226 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  37.79 
 
 
209 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 
206 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
442 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
458 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
442 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
442 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.49 
 
 
442 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
345 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
340 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  37.79 
 
 
209 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 
340 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.7 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  43.41 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 
345 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  39.88 
 
 
345 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
455 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
456 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  39.88 
 
 
456 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.01 
 
 
196 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  41.25 
 
 
185 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  40.37 
 
 
360 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  35.85 
 
 
212 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  36.53 
 
 
198 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 
214 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  39.31 
 
 
349 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  37.8 
 
 
205 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 
250 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  36.72 
 
 
284 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  36.55 
 
 
210 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.59 
 
 
252 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  39.44 
 
 
200 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.46 
 
 
320 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  37.57 
 
 
245 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  39.13 
 
 
394 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.73 
 
 
192 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
181 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3021  segregation and condensation protein B  34.72 
 
 
318 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 
254 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  36.9 
 
 
197 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.93 
 
 
200 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.77 
 
 
190 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.8 
 
 
196 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 
198 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  34.93 
 
 
226 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  36.09 
 
 
178 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  44.63 
 
 
196 aa  101  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  34.5 
 
 
246 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  37.58 
 
 
385 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  36.88 
 
 
185 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  36.67 
 
 
198 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  32.53 
 
 
192 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.72 
 
 
196 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>