285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2995 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  75.96 
 
 
252 aa  274  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  76.3 
 
 
196 aa  263  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  66.13 
 
 
193 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.93 
 
 
320 aa  238  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  70 
 
 
224 aa  236  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  68.21 
 
 
282 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  64.57 
 
 
261 aa  230  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  66.48 
 
 
241 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  62.78 
 
 
191 aa  227  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  58.43 
 
 
205 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  64.74 
 
 
251 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.71 
 
 
220 aa  201  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  60 
 
 
279 aa  200  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.9 
 
 
205 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.6 
 
 
193 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  64.2 
 
 
253 aa  197  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  52.75 
 
 
252 aa  194  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.14 
 
 
224 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.04 
 
 
221 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  57.14 
 
 
224 aa  188  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  51.53 
 
 
229 aa  187  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  61.01 
 
 
191 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  57.67 
 
 
243 aa  185  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  55.21 
 
 
231 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  55.21 
 
 
231 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  55.21 
 
 
231 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  59.12 
 
 
238 aa  181  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  54.71 
 
 
231 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  55.81 
 
 
238 aa  177  5.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  57.41 
 
 
229 aa  173  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  52.75 
 
 
241 aa  171  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.76 
 
 
254 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.89 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.57 
 
 
237 aa  160  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.3 
 
 
225 aa  155  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.34 
 
 
269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  46.15 
 
 
284 aa  138  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  43.35 
 
 
243 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  44.2 
 
 
195 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  45.06 
 
 
237 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.25 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.51 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  42.51 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.86 
 
 
534 aa  111  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.65 
 
 
193 aa  111  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.51 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  41.72 
 
 
274 aa  111  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  41.51 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.92 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.62 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
190 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  41.14 
 
 
372 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
190 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.69 
 
 
211 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 
352 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.14 
 
 
387 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
190 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
190 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 
190 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
190 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
190 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  38.12 
 
 
190 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  37.22 
 
 
206 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.29 
 
 
195 aa  104  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  40.57 
 
 
387 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 
299 aa  104  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 
179 aa  104  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  44.27 
 
 
353 aa  104  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.73 
 
 
196 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  31.58 
 
 
237 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 
171 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.18 
 
 
179 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 
185 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  32.95 
 
 
282 aa  102  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  30.17 
 
 
195 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  32.34 
 
 
201 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  39.38 
 
 
195 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.88 
 
 
206 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.46 
 
 
273 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  29.71 
 
 
195 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  32.92 
 
 
183 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.28 
 
 
200 aa  99  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  38.55 
 
 
221 aa  98.6  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  36.93 
 
 
222 aa  99  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  32.61 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  37.74 
 
 
193 aa  98.2  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  33.72 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  35.22 
 
 
190 aa  97.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  36.88 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  36.97 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  32.1 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  32.1 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  40.54 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  33.53 
 
 
199 aa  94.7  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  33.54 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>